Atelier 1
Bonnes pratiques d'analyses et panel design
Co-animatrices : Anne-Laure Iscache (Infinity - Toulouse) et Manon Farcé (CRCT - Toulouse)
Cet atelier a pour but d’acquérir les bonnes pratiques pour concevoir des panels multicouleurs, générer des données de qualité et préparer ses données pour réaliser des analyses conventionnelles ou multidimensionnelles.
Après un rappel des point clés pour générer des données de bonne qualité (préparation/acquisition des échantillons) nous vous présenterons comment :
- Concevoir vos panels multicouleurs (8 à 30 couleurs) pour minimiser les problématiques liées à la compensation et à l’étalement des données, maximiser la résolution du signal, et obtenir une qualité de données optimisant l’analyse manuelle ou non-supervisée.
- Préparer vos données à l’analyse avec n’importe quel logiciel de retraitement à travers un workflow de nettoyage des données (contrôle qualité des échantillons, transformation, compensation, normalisation...).
La formation se déroulera sous forme de cours et d’exercices.
Public : Technicien.nes, ingénieur.es, étudiant.es, chercheur.es pratiquant la cytométrie.
Pré-requis : Pratique régulière de la cytométrie en flux. Être familiarisé avec les données de cytométrie en flux.
Modalités pratiques : La formation se déroule en français.
Objectifs :
- Connaître les points critiques pour une bonne préparation des échantillons.
- Connaître les étapes clés pour réaliser une bonne acquisition de ces échantillons.
- Savoir construire un panel multicouleurs (brillance des fluorochromes, association fluorochromes/marqueurs, compensation, étalement des données).
- Connaître les différentes étapes nécessaires pour réaliser une analyse de qualité : présentation d’un workflow de nettoyage des données.