Atelier 11
Analyses post-clustering des pourcentages et des intensités
Animateur : Samuel GRANJEAUD (Marseille)
Objectifs de l’atelier :
- Comprendre les méthodes d’analyses post-clustering.
- Présenter et utiliser l'outil sur un jeu de données public afin de découvrir l'interface graphique.
- Lire et exploiter les résultats d'analyse classiques (edgeR, PCA...).
- Discuter le contenu des rapports générés automatiquement.
- Contrôler la qualité des données avant l’analyse (PCA, effet batch...).
- Revoir les étapes d'une analyse non supervisée (diaporama, selon temps disponible).
Pré‐requis des candidats(es) : Pratique régulière des analyses de cytométrie.
Nombre de participant(e)s : 6 maximum (atelier ouvert à partir de 2 personnes).
À qui s’adresse cet atelier :
Toute personne ayant réalisé des analyses non supervisées.
Modalités pratiques :
L’atelier se déroulera en français. Apporter un ordinateur portable pour se connecter par Wifi au cloud de l'IFB.
Type d’instrumentation utilisée :
Utilisation d'Analycyte à travers le cloud de l'Institut Français de Bioinformatique.
- Logiciel : https://biosphere.france-bioinformatique.fr/catalogue/appliance/231/
- Documentation : https://i-cyto.quarto.pub/analycyte-fr/
Lieu :
BU Le Cortex
6 rue Sully - 21000 Dijon
Station Tram-T1 : ERASME