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SFM 2023

4-6 octobre 2023 - Le Couvent des Jacobins - Rennes

Bandeau - SFM 2023
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Jeudi 5 octobre - Après-midi

Sessions parallèles

Grand Auditorium - Niv. -2

14:30-15:15
Logo ModernaSYMPOSIUM Moderna

Modérateurs : Samira Fafi Kremer & Jérôme Le Goff

mRNA innovation: a new era for vaccination and patient care
14:30-14:50
  • News on mRNA technology and the pipeline
    Arnaud Cheret (Moderna)
14:50-15:10
  • Respiratory viruses in transplant patients: the need for prevention
    Pr Jérôme Le Goff (Université Paris Cité - Hôpital Saint-Louis)
15:10-15:15
  • Questions and answers

Salle 3&4 - Niv. -1

14:30-14:45
SYMPOSIUM Présentation du Programme d’Équipement Prioritaire de Recherche “Systèmes Alimentaires, Microbiome et Santé”, objectifs et actions

Modérateurs : Gérard Lina & Marie-Frédérique Lartigue


14:45-15:15
SYMPOSIUM Antibiogrammes ciblés

Modérateurs : Gérard Lina & Marie-Frédérique Lartigue

  • Antibiogramme ciblé pour les infections urinaires à entérobactérie chez la femme : nouvelles recommandations SPILF/SFM labellisée par la HAS
    Frédéric Schramm (CHRU de Strasbourg) & Vanina Meyssonnier (SPILF, Paris)

Changement de salle


Sessions parallèles

Salle 2 - Niv. -1

15:15-16:45
SP15 - T - Pathogénie microbienne - Modélisation +

Microbial communities: from single cell to ecosystem approaches

Chairs: Olivier Dussurget & Charlotte Oriol

  • Mechanisms of biofilm formation and functions at single-cell resolution
    Knut Drescher (University of Basel, Switzerland)

Selected short oral presentations

  • Identification of genes involved in the structure and strength change of Klebsiella pneumoniae biofilm
    Ibrahima Dramé (Laboratoire Microorganismes: Génome Environnement, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France)
  • Genomic variations in Mycobacterium tuberculosis from pulmonary and extrapulmonary isolates: Insights into compartmentalization
    Charlotte Genestet (Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), Lyon, France)
  • Metal homeostasis during host cells infection by adherent invasive E.coli
    Hosni Nedjar (Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie (CIRB), Collège de France, Paris, France)
  • Comparative study of intracellular biofilms formed by clinical Adherent-Invasive E. coli
    Emma Bruder (Chromosome dynamics, CIRB, Collège de France, INSERM U1050, CNRS UMR7241, PSL University, Paris, France)

Salle Les Horizons - Niv. 2

15:15-16:45
SP16 - Virologie fondamentale +

Host virus interaction

Chairs: Céline Bressollette-Bodin & Florent Marty

  • Intrinsic and innate immune responses against RNA viruses
    Caroline Goujon (IRIM, CNRS, Montpellier)

Selected short oral presentations

  • APOBEC3G editing in HIV-1 group O genomes
    Maria-Alexandra Stoica (Univ. Rouen Normandie, INSERM, DYNAMICURE UMR 1311, CHU Rouen, Department of Virology, National Reference Center of HIV, Rouen, France)
  • Equine infectious Anemia Virus treatment strategies: targeting the virus or the host?
    Cécile Schimmich (PhEED, ANSES Laboratoire de Santé Animale, Goustranville, France)
  • Viral and human transcriptomic investigation of cerebrospinal fluid specimens from patients with herpes simplex virus and varicella-zoster virus infections of the central nervous system
    Sonia Burrel (CHU de Bordeaux, Virologie, Université de Bordeaux, CNRS UMR 5234, MFP Spacvir, Bordeaux, France)
  • Rôle antiviral du cluster de miRNA C19MC dans les vésicules extracellulaires placentaires lors des infections virales congénitales
    Gaëtan Ligat (Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), INSERM UMR1291 - CNRS UMR5051 - Université Toulouse III, CHU Purpan, Toulouse, France)

Salle 3&4 - Niv. -1

15:15-16:45
SP17 - Microbiologie des aliments / One Health +

La microbiologie des aliments dans le contexte du « One Health »
(santé humaine, animale et environnementale)

Modératrices : Pauline Kooh & Caroline Le Maréchal

  • Évolution du risque lié à Vibrio parahaemolyticus dans les huîtres lié au réchauffement climatique et stratégies de prévention
    Anne Thébault (Anses, Maisons-Alfort)

Communications orales courtes sélectionnées

  • Évaluation de la qualité microbiologique des larves de mouches de Hermetia illucens pour l’alimentation humaine et animale : quel est l’impact du substrat ?
    Lenaïg Brulé (UMR INRAE 1014 SECALIM, Oniris-INRAE, Nantes, France)
  • Genetic diversity and soil fitness of Listeria monocytogenes in the pig manure recovery sector
    Jean Lagarde (UR OPAALE, INRAE, Rennes, France)
  • Caractérisation du danger Clostridium perfringens dans les filières bovine, porcine et volaille à l’abattoir
    Christina Tran (Unité Staphylococcus, Bacillus et Clostridium, Anses, Maisons-Alfort, France)
  • Impacts au niveau microbien, immunitaire et physiologique de l’application post-traite d'une souche de bactérie lactique sur la peau du trayon pour la prévention des mammites bovines
    Coralie Goetz (STLO, INRAE, Institut Agro Rennes-Angers, Rennes, France)
  • Devenir de Clostridioides difficile au cours de la méthanisation mésophile agricole
    Caroline Le Maréchal (Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort Unité HQPAP, Anses, Ploufragan, France)

Salle 5&6 - Niv. -1

15:15-16:45
SP18 - Environnement +

Interactions microbiennes dans l’environnement

Modérateurs : Julie Leloup & Philippe Vandenkoornhuyse

  • Holobiont and hologenome as additional level of biological organization: validity and prospects
    Philippe Vandenkoornhuyse (UMR ECOBIO, Université Rennes 1, Rennes)

Communications orales courtes sélectionnées

  • Études des paramètres intervenant dans la bioremédiation du benzo(a)pyrène par le champignon tellurique Talaromyces helicus en colonne de sol
    Salomé Bertone (METIS, Sorbonne Université, Paris, France)
  • Bioremédiation des PCB par des microorganismes fongiques et bactériens
    Thibault Le Gratiet (Laboratoire d’Ecologie Microbienne (LEM), Université Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne, France)
  • The addition of isolated rhizobacteria and commercial arbuscular mycorrhizal fungi synergistically modifies the microbiome associated with the roots of young vines
    Romain Darriaut (Ecobio, Univ. Rennes, CNRS, Rennes, France)
  • FungiSol: A citizen science project to investigate environmental yeasts in urban soils
    Isabelle Ourliac-Garnier (UR1155 - IICiMed, Nantes Université, Nantes, France)

Salle 1 - Niv. -2

15:15-16:45
SP19 - Microbiologie clinique - Parcours formation continue - Session Qualiopi +

Logo COL_BVHQuoi de neuf dans le tube digestif ? (en association avec le Col.BVH)

Modératrices : Sophie Jarraud & Anne Cady

  • Escherichia coli producteur de Shiga toxine : passons le STEC au Grill…
    Stéphane Bonacorsi (APHP, Paris)
  • La détection de pathogènes digestifs dans les selles à l’ère de la biologie moléculaire : quel impact en pratique clinique
    Nicolas Benech (CHU, Lyon)

Communications orales courtes sélectionnées

  • Analyse métabolomique de l’impact de l’antibiothérapie anténatale dirigée contre le Streptocoque du groupe B sur le microbiote intestinal du nourrisson
    Cécile Guyonnet (Laboratoire de Bactériologie, Hôpital Cochin, Paris, France)
  • Role of the mucin protease Vat in colorectal tumorigenesis of colibactin-producing Escherichia coli
    Héloïse Chat (M2ISH / INSERM 1071, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France)

Grand Auditorium - Niv. -2

15:15-16:45
SP20 - Antimicrobiens / Microbiote +

Microbiote et antibiorésistance

Modérateurs : Mathilde Lescat & Vincent Cattoir

  • Le résistome du microbiote intestinal : caractérisation, dynamique et opportunités
    Étienne Ruppé (APHP, Paris)

Communications orales courtes sélectionnées

  • Diversity and antibiotic resistance of Escherichia coli species within the intestinal microbiota in relation to dietary fiber intake
    Maïra Saperas-Ghezali (U1153, Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (EREN), INSERM Université Sorbonne Paris Nord and Université Paris Cité, INRAE, CRESS, Bobigny, France)
  • Élaboration d’une formulation combinant souches probiotiques et extraits végétaux ciblant les souches Escherichia coli adhérents/invasifs (AIEC) associées à la maladie de Crohn
    Fanny De Clercq (Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l’Hôte, UMR1071 Inserm/Université Clermont Auvergne - USC INRAE 1382, Clermont-Ferrand, France)
  • PROMISE, un méta-réseau One Health de lutte contre l’antibiorésistance en France
    Yohann Lacotte (RESINFIT, U 1092, Univ. Limoges, Inserm, CHU Limoges, Limoges, France)
  • ABRomics: an integrated multi-omics platform for antibiotic resistance research and public health
    Claudine Médigue (UAR3601, CNRS Institut Français de Bioinformatique, Évry, France)
  • Diversité et succès écologiques des Escherichia coli ST131 associés à la colonisation de l’hôte
    Richard Bonnet (M2ISH, UMR Inserm 1091, Univ. Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France)

16:45-17:15

Grand Foyer & Carré - Niv. -2Pause café - Visite de l’exposition

Grand Foyer & Petit Foyer - Niv. -2 Posters


17:15-18:00

Grand Foyer & Petit Foyer - Niv. -2 SESSION POSTERS affichés 1 - Numéros impairs


17:15-18:00

Petit Foyer - Niv. -2 SESSION POSTERS commentés 1

Modérateurs : Valentine Berti & Olivier Dussurget

Pour voir la liste des posters commentés : cliquer ici


Sessions parallèles

Salle 3&4 - Niv. -1

18:00-19:30
SP21 - Pathogénie microbienne +

Logo SFIInnate immunity: the gatekeepers? (in association with SFI)

Chairs: Olivier Neyrolles & Florent Marty

  • Mechanisms of cell deaths in infectious diseases
    Étienne Meunier (CNRS/IPBS, Toulouse)
  • Layers of immunity: Deconstructing the Drosophila effector response
    Bruno Lemaitre (EPFL, Lausanne, Suisse)

Selected short oral presentations

  • Interaction between Chitinase 3-like 1 (CHI3L1) and bacterial protein ChiA: a decisive step for Crohn’s disease-associated adherent and invasive E. coli to enter within human macrophages
    Margot Fargeas (M2iSH, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France)
  • Development of trained immunity and activation of inflammasomes are promising strategies to combat Staphylococcus aureus infection
    Nadia Nadejda Berkova (INRAE, Institut Agro, Rennes, France)

Salle Les Horizons - Niv. 2

18:00-19:30
SP22 - Virologie +

Logo SFVVirus aquatiques (en association avec la SFV)

Modérateurs : Vincent Thibault & Eloi Verrier

  • Les virus dans le cycle du carbone marin
    Anne-Claire Baudoux (CNRS, Roscoff)
  • Itinéraire d’un virus. Enquête en poisson zèbre
    Christelle Langevin (INRAe, Jouy-en-Josas)

Communications orales courtes sélectionnées

  • L’approche métagénomique basée sur le séquençage d’amplicons révèle la grande diversité génomique des souches de norovirus dans les huîtres contaminées
    Joanna Ollivier (RBE/MASAE/LSEM, Ifremer, Nantes, France)
  • Identification de variants du SARS-CoV-2 par séquençage MiSeq dans les eaux usées de métropoles françaises : Intérêt de l’échantillonnage passif
    Françoise Vincent-Hubert (MASAE/LSEM, Ifremer, Nantes, France)

Salle 1 - Niv. -2

18:00-19:30
SP23 - Biodiversité et évolution +

Biodiversity & Evolution

Chairs: Olaya Rendueles-Garcia & Cécile Monard

  • The soil microbiote under control
    Cécile Monard (Université Rennes 1, Rennes)

Selected short oral presentations

  • Deciphering the emergence of host adaptation of the most virulent pathogenic Leptospira species
    Alexandre Giraud-Gatineau (Biologie des Spirochètes, Institut Pasteur, Paris, France)
  • Yersinopine: a fight for metals across evolution
    Pascal Arnoux (MEM, CEA, BIAM, Saint-Paul-lez-Durance, France)
  • Functional and evolutionary consequences of capsule swap in Klebsiella pneumoniae
    Julie Le Bris (CNRS UMR3525, Microbial Evolutionary Genomics Unit, Institut Pasteur, Paris, France)
  • Identification, rôles et origine de petits ARN interférents chez le parasite minimaliste Anncaliia algerae
    Reginald Florian Akossi (UMR 6023 LMGE Équipe IHP, UMR UCA CNRS, Aubière, France)

Salle 2 - Niv. -1

18:00-19:30
SP24 - Biotechnologies microbiennes +

Logo AFCInterêt de la CMF en Biotechnologies microbiennes (en association avec l’AFC)

Modératrices : Marielle Bouix & Hélène Velly

  • De la constitution de banques de souches jusqu’aux étapes de contrôle de la qualité : utilité de la cytométrie en flux pour les applications portant sur les probiotiques de nouvelle génération issus du microbiote intestinal
    Vincent Thomas (Lallemand Heath solutions, Blagnac)
  • Applications de la cytométrie en flux à l’industrie des vaccins vétérinaires
    Jean Reyes (VIRBAC, Nice)

Communications orales courtes sélectionnées

  • État redox intracellulaire et métabolisme de Clostridia solvantogènes : l’apport de la cytométrie en flux
    Hélène Velly (Département Biotechnologie, IFPEN, Rueil-Malmaison, France)
  • Observation de modifications morphologiques au sein d’une population d’Escherichia coli productrice de protéines recombinantes grâce à un suivi en ligne par cytométrie en flux
    Agnès Hocquellet (CBMN UMR 5248 CNRS, Université de Bordeaux, ENSTBB - Bordeaux INP, Bordeaux, France)

Grand Auditorium - Niv. -2

18:00-19:30
SP25 - Microbiologie clinique - Parcours formation continue - Session Qualiopi +

Logo SPILFLe destin des maladies infectieuses humaines et animales : éradication et ré-émergence
(en association avec la SPILF)

Modérateurs : Valentine Berti & Sylvain Brisse

  • Écueils du programme d’éradication polio & déploiement d’un nouveau vaccin antipoliomyélitique oral pour endiguer les épidémies
    Maël Bessaud (Institut Pasteur, Paris)
  • La diphtérie, maladie oubliée, à l’ère de la génomique
    Sylvain Brisse (Institut Pasteur, Hôpital Necker-Enfants malades, Paris)

Communications orales courtes sélectionnées

  • Évaluation de 11 kits de PCR en temps réel pour le diagnostic direct de la borréliose de Lyme
    Emilie Talagrand-Reboul (UR7290, ITI InnoVec, Faculté de Médecine, Université de Strasbourg, Strasbourg, France)
  • Vaccine safety of a new toxoid-based vaccine against Clostridioides difficile infection in rabbits
    Mickaël Riou (UE-1277 Plateforme d'Infectiologie expérimentale, INRAE, Nouzilly, France)

Salle 5&6 - Niv. -1

18:00-19:30
SP26 - T - Antimicrobiens - Mycologie / Parasitologie - Virologie +

Nouvelles thérapeutiques anti-infectieuses (bactéries, virus, champignons, parasites)

Modératrices : Isabelle Broutin & Typhaine Brual

  • Outils chimiques pour l’étude de L,D-Transpeptidases impliquées dans la synthèse de la paroi cellulaire des bactéries
    Mélanie Etheve-Quelquejeu (Paris)

Communications orales courtes sélectionnées

  • Interdisciplinary approach for aptamer-based specific delivery to infectious sites of anti-infective compounds from medieval Arab pharmacopoeia
    Chaimae Mezouarhi (UMR7021 Laboratory of Bioimaging and Pathologies, CNRS University of Strasbourg, Ilkirch, France)
  • Harnessing innovative enzymes to combat phytopathogenic bacteria and fungi
    Baptiste Kergaravat (Gene&GreenTK, Marseille, France)
  • Identification of a squalamine derivative with anti-biofilm properties on Pseudomonas aeruginosa
    Anne-Sophie Tareau (CBSA, Université de Rouen, Evreux, France)

19:30

La Halle 1 - Niv. 1Cocktail dînatoire

26/09/2023