SFM 2025

24-26 septembre 2025 - Palais de Congrès de Bordeaux

Bandeau - SFM 2025
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Mercredi 24 septembre

10:00-13:00
6e Forum “Carrières en Microbiologie” pour les jeunes microbiologistes

Pour plus d’informations : cliquer ici


13:00

Déjeuner du Forum “Carrières en Microbiologie”


Session accessible seulement sur inscription spécifique préalable
11:00-17:00
Symposium Grippe et Virus respiratoires

Les virus respiratoires à l’ère de l’innovation : défis et avancées

Voir le programme +-
11:00-11:10
Accueil : Bruno Lina
11:10-12:00
Session 1
  • Circulation des virus respiratoires en 2024-2025 : une épidémie de grippe hors norme ?
    Représentant Santé publique France & Antonin BAL (CNR virus des infections respiratoires, Lyon)
  • Point de situation grippe H5
    Marie-Anne RAMEIX-WELTI (CNR virus des infections respiratoires, Paris)
12:00-13:00
Session 2 - Innovations du côté de la surveillance et de l’analyse
  • Vers de nouveaux modes de surveillance
    Représentant Santé publique France & Antonin BAL (CNR virus des infections respiratoires, Lyon)
  • Estimation de l’efficacité vaccinale en temps réel par le réseau RELAB
    François BLANQUART (Collège de France)
  • Intelligence artificielle pour la modélisation des épidémies
    Mircea SOFONEA (Université de Montpellier)

13:00-14:00

Déjeuner du Symposium Grippe et Virus respiratoires


14:00-14:50
Session 3 - Innovations du côté du diagnostic
  • Place de la réponse immunitaire dans le diagnostic des infections respiratoires virales
    Sophie ASSANT (Centre International de Recherche en Infectiologie)
  • Place du séquençage sans à priori dans le diagnostic des infections respiratoires virales
    Grégory DESTRAS (Hospices Civils de Lyon)
  • Évaluation des tests de sous-typage grippe
    Richard CHALVIGNAC (Hospices Civils de Lyon)
14:50-16:00
Session 4 - Innovations du côté de la prévention et de la prise en charge
  • Prise en charge en ville
    Benoit VISSEAUX (CERBA) & Médecin généraliste (à confirmer)
  • Vacciner contre les infections respiratoires pour éviter les surinfections bactériennes
    À confirmer
  • Prévention vaccinale : innover dans les stratégies, nouvelles plateformes vaccinales
    Odile LAUNAY (CIC Cochin-Pasteur)
16:00-16:55
Workshop - Bioinformatique et séquençage des virus respiratoires : analyser simplement les données NGS

Coordination : Hadrien REGUE, Richard CHALVIGNAC & Antonin BAL

16:55-17:00
Clôture du Symposium Grippe et Virus respiratoires

Session accessible seulement sur inscription spécifique préalable
13:30-18:00
Symposium Mycologie / Parasitologie
Voir le programme +-
13:30-15:30
Actualités en Parasitologie-Mycologie
 

Modérateurs : Grégory KARADJIAN & Françoise BOTTEREL

  • « Qu’est ce qui m’a piqué docteur ? » Un algorithme très simple pour identifier le responsable
    Pascal DELAUNAY (Nice)
  • Le paludisme : épidémiologie actuelle et nouveaux outils prophylactiques
    Marc THELLIER (Paris)
  • Comment améliorer la qualité et l’interprétation des prélèvements pour les mycoses superficielles ?
    Françoise FOULET (Créteil)
  • Spectrométrie Masse : Identification et surveillance des infections fongiques
    Arnaud FEKKAR (Paris)

15:30-16:00

Espace Pluriel - RdCPause café


16:00-18:00
Changement climatique et Parasitologie-Mycologie
 

Modérateurs : Arnaud FEKKAR et Laurence DELHAES

  • Changement climatique et pathogènes fongiques : à quoi s’attendre dans un contexte One Health ?
    Françoise BOTTEREL (Créteil)
  • Les arthropodes vecteurs à l’heure des changements : des nouveaux envahisseurs aux portes de la France ?
    Jérôme DEPAQUIT (Reims)
  • Émergence de Candida auris : rôle de l’impact environnemental
    Guillaume DESOUBEAUX (Tours)
  • Émergence de l’Angiostrongylose en Europe : impact de l’invasion des mollusques
    Gregory KARADJIAN (Maisons-Alfort)

Congrès SFM Microbes 2025

11:00-12:30
Réunion des responsables de sections

12:30

Déjeuner des responsables de sections


12:30-13:30

Espace Pluriel - RdCAccueil des participants


Sessions plénières
13:30-13:35
Mot d’accueil de la Présidente

Amphi. A - RdC

Sonia BURREL - Présidente de la SFM


13:35-14:20
Conférence plénière
+-

Alain Blanchard

Descriptif à venir.


Modérateurs : Sabine PEREYRE & Éric OSWALD

Alain BLANCHARD (Université de Bordeaux)

  • De la génomique à la biologie de synthèse pour un meilleur contrôle des infections à mycoplasmes

14:20-14:50
PAROLE aux industriels
  • Logo NoulNoul
  • Logo Thermo Fisher ScientificThermo Fisher Scientific
  • Logo IlluminaIllumina
  • Logo bioMerieuxBioMérieux
  • Logo NephrotekNephrotek

14:50-15:35

Espace Pluriel - RdCPause café - Visite de l’exposition - Posters


Sessions plénières
15:35-17:05
AUDITION Prix de thèse

Amphi. A - RdC


17:05-17:10
Logo MicroBio-NARéseau MicroBio-NA

17:10-17:55
Session PPR Antibiorésistance
+-

Évelyne JOUVIN-MARCHE

Descriptif à venir.


Modérateurs : Gérard LINA & Marion DUTKIEWICZ

Henri BOULLIER (Cnrs, IRISSO, Université Paris Dauphine - PSL)

  • Pour une approche écologique de l’antibiorésistance à l’heure des transitions

Évelyne JOUVIN-MARCHE (Inserm, Institut Physiopathologie Métabolisme Nutrition, Paris)

  • Les nouvelles actions du Programme Prioritaires de Recherche sur l’Antibiorésistance

17:55-18:00

Changement de salle


Sessions parallèles
18:00-19:30
SP1 - Sécurité et sûreté biologiques +-

Retex sur les contraintes de sécurité et de sûreté biologiques des laboratoires en microbiologie

SP1 - Sécurité et sûreté biologiques

Retex sur les contraintes de sécurité et de sûreté biologiques des laboratoires en microbiologie

Dans cette session pourront être présentés tous les travaux relatifs aux questionnements réalisés pour mettre en place et maintenir les aspects pratiques de la sécurité et la sûreté biologiques dans les laboratoires de microbiologie (fondamental, médical, vétérinaire, phytopathogènes...). L’objectif de cette session est de présenter des retours d’expériences dans différents secteurs de la microbiologie pour faire progresser la sécurité globale dans un contexte réglementaire strict tout en restant pragmatique.


Modérateurs : Mathilde LESCAT & Sébastien ALLIX

  • SP1-O.1 - Biosûreté et Biosécurité dans les laboratoires de Niveau de Sécurité Biologique de 2 à 4
    Fabienne NEULAT-RIPOLL

Communications orales courtes sélectionnées

  • SP1-1 - La Plateforme Universitaire UB’L3, une structure permettant des expériences répondant à un haut niveau de sécurité et de sureté biologiques
    Patricia RECORDON-PINSON (UBL3 TBMcore, Université de Bordeaux, Bordeaux, France)
  • SP1-2 - Évaluation de l’efficacité du désinfectant Contec ProChlor contre Burkholderia pseudomallei et Burkholderia mallei
    Mégane GASQUÉ (LSAN-UZB, ANSES, Maisons-Alfort, France)
  • SP1-3 - Prise en charge d’un prélèvement positif à Francisella tularensis : RETEX biosureté
    Coralie BOUCHIAT (Bactériologie - Biologie moléculaire, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France)
  • SP1-4 - Virucidal activity of antiseptics and disinfectants used in the medical area - Replacement of poliovirus in EN 14476 in the framework of the Global Polio Eradication Initiative
    Nicolas CAPELLI (ACM Pharma Fonderephar, Toulouse, France)

18:00-19:30
SP2 - Modélisation / IA +-

Mathematical modeling and novel quantitative approaches to characterize microbial dynamics

SP2 - Modélisation / IA

Mathematical modeling and novel quantitative approaches to characterize microbial dynamics

Descriptif à venir.


Chairs: Sophie JARRAUD & Jérémie GUEDJ

  • SP2-O.1 - The population biology of pathogenicity of Escherichia coli
    François BLANQUART (Collège de France)

Selected short oral presentations

  • SP2-1 - Evaluation of Large Language Models for Predicting Antibiotic Sensitivities in UTI Patients: A Comparison with Real Observed Values Obtained from a Laboratory Epidemiological Tool Predi-ATB
    Yohann MISSIAK (IA, CBM Inovie, Albi, France)
  • SP2-2 - Artificial Intelligence-Based Prediction of Antibiotic Susceptibility in Major Pathogens Isolated from Blood Cultures in Private Healthcare Facilities
    Matthieu BERNIER (Laboratoire régional microbiologie Occitanie Ouest, INOVIE CBM, Muret, France)
  • SP2-3 - Understanding OsHV-1 µVar transmission dynamics in Pacific oysters through a mechanistic and stochastic SWEIRD Model
    Jules TRILLAUD (Adaptation Santé des Invertébrés Marins, Ifremer, La Tremblade, France)
  • SP2-4 - Intégration des enjeux sanitaires dans l’Analyse du Cycle de Vie : développement d’un facteur de caractérisation spatialisé à l’échelle de la France pour Listeria monocytogenes
    Pascal PIVETEAU (UR OPAALE, INRAE, Rennes, France)

18:00-19:30
SP3 - Microbiologie clinique +- Parcours formation continue - Session Qualiopi

Logo sfpMaladies à transmissions vectorielles et zoonoses
(en association avec la SFP)

SP3 - Microbiologie clinique

Maladies à transmissions vectorielles et zoonoses

Descriptif à venir.


Modérateurs : Alban LE MONNIER & Marie-Frédérique LARTIGUE

  • SP3-O.1 - Borréliose de Lyme et autres maladies vectorielles à tiques : quoi de neuf dans les recommandations ?
    Benoit JAULHAC (Université de Strasbourg)
  • SP3-O.2 - Titre à venir
    Orateur à confirmer

Communications orales courtes sélectionnées

  • SP3-1 - Métatranscriptomique et borrélioses : dépasser les limites diagnostiques chez les patients sous anti-CD20
    Grégory DESTRAS (Institut des Agents Infectieux, Plateforme de séquençage, GenEPII, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France)
  • SP3-2 - Best-of des pièges diagnostiques de la sérologie Borréliose de Lyme
    Emilie TALAGRAND-REBOUL (Laboratoire de Bactériologie et CNR des Borrelia, Hôpitaux universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France)

18:00-19:30
SP4 - Microbiologie des aliments +-

La microbiologie des produits fermentés entre tradition et modernité

SP4 - Microbiologie des aliments

La microbiologie des produits fermentés entre tradition et modernité

Si les boissons et les aliments fermentés existent depuis des millénaires et sont fortement associés à l'identité culturelle et gastronomique des régions productrices; ces dernières années, en lien avec la demande sociétale de naturalité et les transitions alimentaires, on constate un engouement pour les produits fermentés traditionnels mais également un développement de produits fermentés innovants. Ainsi, ces produits d'importance en nutrition humaine et de par leur poids économique évoluent entre tradition et modernité. Les écosystèmes microbiens associé à ces produits contiennent des microorganismes qui interagissent constamment et coévoluent. Dans ce contexte, il est primordial de comprendre comment ces microorganismes impactent la qualité et/ou la sécurité des produits finis, en particulier sur des matrices moins utilisées. Cette session s’ouvre donc à tous les travaux sur les produits fermentés, que ce soit des produits traditionnels ou innovants.


Modérateurs : Monika COTON & Claire LE HÉNAFF

  • SP4-O.1 - La microbiologie du vin : entre tradition et innovation
    Pr Warren ALBERTIN (Université de Bordeaux)

Selected short oral presentations

  • SP4-1 - Evaluation of a microbiome engineering approach using lactic acid bacteria as bioprotective cultures to extend the shelf life of Gilthead Seabream (Sparus aurata) fillets
    Sabrina MACÉ (Unité MASAE, Microbiologie Aliment Santé Environnement/Laboratoire EM3B, IFREMER, Nantes, France)
  • SP4-2 - Vers des stratégies de biopréservation : Exploration de la diversité et interactions des Pseudomonas altérants dans les produits laitiers
    Darina COLCANAP (Laboratoire d’Ingénierie des Biomolécules (LIBio), Université de Lorraine, Vandoeuvre-lès-Nancy, France)
  • SP4-3 - Impact of a well-defined indigenous starter on microbial communities and technological properties of raw milk during backslopping practice
    Christel COUDERC (Ecole d'Ingénieurs de Purpan, Toulouse, France)
  • SP4-4 - Exploiting bacterial biodiversity allows development of probiotic fermented vegetable foods for the prevention of IBD and IBS
    Gwénaël JAN (STLO, INRAE, Rennes, France)
  • SP4-5 - Microbial transfers of traditional Saint-Nectaire PDO cheeses during cheese wiping under controlled conditions highlighted by omics method
    Reshad FANTELLI (Laboratoire d’Analyses Spatiales et Temporelles des Expositions Chimiques, INRS, Nancy, France)

18:00-19:30
SP5 - Antimicrobiens +-

Anti-resistance strategies: vectorization, adjuvants, inhibitors, antiplasmid

SP5 - Antimicrobiens

Anti-resistance strategies: vectorization, adjuvants, inhibitors, antiplasmid

This session will address the multiple strategies to potentiate antimicrobials available in the pharmacopoeia and escape resistance mechanisms or by restoring susceptibility. This may be vectorization to facilitate entry into the microorganisms, adjuvants, inhibitors or methods to eliminate resistance plasmids.


Chairs: Philippe GLASER & Valentine BERTI

  • SP5-O.1 - Bacterial Iron Uptake Pathways: Unlocking Antibiotic Entry through Vectorization
    Isabelle SCHALK (Université de Strasbourg - CNRS, Illkirch)

Selected short oral presentations

  • SP5-1 - Innovative dual antimicrobials development to target MDR pathogens and limit the emergence of resistance: focus on the potential of a new target
    Jérome WAGNER (ARN-UPR9002, CNRS, Strtasbourg, France)
  • SP5-2 - A thoughtful combination of Tequatrovirus/Vectrevirus bacteriophages allows mice gut decolonization of a multidrug-resistant ST131 Escherichia coli strain
    Floriane LAUMAY (Equipe StaPath, CIRI, INSERM U1111 - CNRS UMR5308 - Université de Lyon 1 - ENS, Lyon, France)
  • SP5-3 - Antisense nucleolipid oligonucleotide used for the inhibition of extended-spectrum-β-lactamases in enterobacteria
    Lisa SCILLIA (Laboratoire MFP UMR 5234 Equipe ARMYNE, Université de Bordeaux, Bordeaux, France)
  • SP5-4 - Preuve de concept : effet antibactérien des plasmas froids contre l’infection à Staphylococcus aureus dans un modèle murin de plaies aiguës
    Mickaël RIOU (UE-1277 PFIE, INRAE, Nouzilly, France)

18:00-19:30
SP6 - Épidémiologie et génomique des populations +-

Recent taxonomic proposals for viruses and other microorganisms: why on Earth?

SP6 - Épidémiologie et génomique des populations

Recent taxonomic proposals for viruses and other microorganisms: why on Earth?

This english-speaking session aims to present contemporary approaches and changes in microbial taxonomy that impact diagnostic practice and epidemiological surveillance. The invited speaker will first present a novel proposal for the taxonomy of viruses, including the recent implementation of binomial Linnaean nomenclature for virus species. The session also aims to present contemporary approaches and changes in microbial taxonomy that impact diagnostic practice and epidemiological surveillance.


Chairs: Maxime PICHON & Corentine ALAUZET

  • SP6-O.1 - Taxonomic updates of virus species: Linnean nomenclature and beyond
    Peter SIMMONDS (UK)

Selected short oral presentations

  • SP6-1 - Life Identification Numbers: genome-based multilevel bacterial strain taxonomies
    Sylvain BRISSE (BEBP Unit, Institut Pasteur, Paris, Fance)
  • SP6-2 - WGS in microbiology: how far can interpretation go regarding data quality issues?
    Virginie CHESNAIS (SPAAD, ANSES, Maisons-Alfort, France)
  • SP6-3 - Beyond traditional taxonomic markers: A genomic approach to cyanobacterial taxonomy
    Aniket SARAF (Collection of Cyanobacteria, Institut Pasteur, Paris, France)
  • SP6-4 - A quantitative approach of polymorphism in bacteria beyond synonymous/non-synonymous classification : impact of lifestyle in Escherichia coli/Shigella
    Manolo MISCHLER (Institut Cochin, Paris, France)

19:30

Espace Pluriel - RdCApéritif de Bienvenue

 

15/07/2025