SFM 2025

SP5 - Antimicrobiens

Anti-resistance strategies: vectorization, adjuvants, inhibitors, antiplasmid

This session will address the multiple strategies to potentiate antimicrobials available in the pharmacopoeia and escape resistance mechanisms or by restoring susceptibility. This may be vectorization to facilitate entry into the microorganisms, adjuvants, inhibitors or methods to eliminate resistance plasmids.

SP11 - Antimicrobiens

Monitoring antibiotic effects on bacteria at the cellular level

The anti-infectious efficiency of a drug is a combination of its capacity to enter in the bacteria, to not be expelled out of the cell, to its affinity for its target, and its local concentration. In this session will be presented the bacterial response mechanisms at the scale of the whole cell, studied using different approaches (imaging, cytometry, swarming,…).

SP20 - Antimicrobiens

Antimicrobial tolerance and persistence in natural environments

Studies on the tolerance and persistence of microorganisms to antimicrobials in the different environments in which they evolve will be presented in this session.

SP26 - Antimicrobiens

Exposome and propagation of antibiotic resistance genes in the One Health approach

The objective of this session is to examine the factors that promote the dissemination of antibiotic resistance genes in human, animal and environmental ecosystems. The programme will feature studies that adopt a One Health approach, addressing the ecological and evolutionary aspects of the emergence and spread of antibiotic resistance.

SP36 - Biodiversité et évolution

Marin biodiversity - Structure of mixed/complex populations

Microbial Worlds Unveiled: Ecosystem Dynamics from Genes to Biomes.
This session will combine computational models, multi-omics approaches with cutting-edge experimental techniques to provide new insights into microbial interactions, ecosystem functioning, and environmental health. Abstracts with a strong focus on, (but not limited to), community structure, function and/or horizontal gene transfer are encouraged.

SP25 - Biotechnologies microbiennes

Fermentations : évolution ou révolution ?

Cette session abordera les recherches impliquant la fermentation au sens strict du terme mettant en œuvre les voies fermentaires des microorganismes (production d’acides, alcools) en culture pure ou en culture mixte mais aussi les recherches impliquant les respirations microbiennes dans des procédés biotechnologiques pour la production de biomasse microbienne, de biomolécules, ou de macromolécules. La volonté de développer de nouvelles voies de valorisation d’approvisionnement d’aliments fonctionnels par « fermentation de précision », de biomolécules d’intérêt pharmaceutique, cosmétique, industriel, indépendante des saisonnalités et prenant en compte les défis sociétaux (mobilisation des terres, valorisation des biomasses résiduaires, dépollution, préservation des ressources naturelles, etc) conduit à explorer de nouveaux bioprocédés.

SP31 - Biotechnologies microbiennes

Modeling and Artificial Intelligence: Exploring New Frontiers in Microbial Biotechnology and Metabolic Engineering

Advances in mathematical modeling and artificial intelligence (AI) are opening new avenues for understanding, predicting, and controlling microbial metabolism. This session will explore how these tools can revolutionize microbial biotechnologies by optimizing industrial processes such as anaerobic digestion and bioproduct production. The session will provide an overview of these interdisciplinary approaches and the associated innovation prospects, offering insights into future challenges and opportunities for understanding, mastering, directing, and controlling microbial metabolisms in pure and mixed cultures.

SP37 - Biotechnologies microbiennes

La photosynthèse microbienne au service d’une biotechnologie renouvelable

La photosynthèse microbienne constitue un levier prometteur pour développer des biotechnologies durables, exploitant l'énergie solaire pour produire des composés d'intérêt tout en réduisant l'empreinte environnementale. Cette session mettra en lumière les dernières avancées en ingénierie métabolique, écologie microbienne et bioprocédés, visant à valoriser le potentiel des cyanobactéries et microalgues. Des chercheurs exploreront comment intégrer ces systèmes biologiques dans des applications variées, telles que la bioénergie, la capture de CO₂ et la synthèse de biomolécules. Une occasion unique de découvrir les perspectives offertes par ces acteurs clés de la transition écologique.

SP27 - Environnement

Quoi de neuf à l’hôpital en microbiologie environnementale ?

Cette session a pour but de mettre en lumière le rôle des laboratoires d’hygiène hospitalière et l’importance de leurs connexions avec les équipes de prévention du risque infectieux dans les hôpitaux. Les travaux concernant les analyses microbiologiques des eaux, airs, surfaces ou toute autre analyses innovantes en lien avec l’environnement hospitalier pourront être soumis dans cette session.

SP33 - Environnement

Microbiote des plantes : des racines jusqu’aux feuilles

Le microbiote des plantes : depuis leurs racines jusqu'à leurs parties aériennes, les plantes sont habitées par des micro-organismes. Dans cette session, nous découvrirons quels types d'interactions existent entre plantes et microorganismes ou encore si certains micro-organismes peuvent être utilisés pour une agriculture plus verte…

SP39 - Environnement

Protozoa, key links in food webs: focus on interactions with viruses and bacteria

Protozoa interact with other microorganisms such as bacteria (sometimes pathogenic) or viruses (e.g. giant viruses). This symbiosis is important for the evolution of partners. This session will highlight the full diversity of these interactions.

SP6 - Épidémiologie et génomique des populations

Recent taxonomic proposals for viruses and other microorganisms: why on Earth?

This english-speaking session aims to present contemporary approaches and changes in microbial taxonomy that impact diagnostic practice and epidemiological surveillance. The invited speaker will first present a novel proposal for the taxonomy of viruses, including the recent implementation of binomial Linnaean nomenclature for virus species. The session also aims to present contemporary approaches and changes in microbial taxonomy that impact diagnostic practice and epidemiological surveillance.

SP32 - Innovations pédagogiques

L’étudiant(e) au cœur de l’innovation pédagogique ?

Dans cette session pourront être présentés tous travaux relatifs aux questionnements pour améliorer les techniques utilisées dans les enseignements en Microbiologie fondamentale et médicale.

SP38 - Jeunes microbiologistes

Intelligence artificielle et autres outils informatiques au service des jeunes microbiologistes

En passant par Excel, l’outil « ringard » mais aux atouts évidents, l’intelligence artificielle pour nous sauver des heures de lecture d’articles, tout en gardant un regard critique lors de notre utilisation de ChatGPT : la session jeunes vous donne rendez-vous pour des tips dont vous ne pourrez plus vous passer.

SP3 - Microbiologie clinique

Maladies à transmissions vectorielles

Descriptif à venir.

SP9 - Microbiologie clinique

Pneumopathies typiques et atypiques : une recrudescence à couper le souffle !

Spécificité locale : CNR des IST bactériennes et chlamydia/mycoplasmes.
Après une épidémie historique d'infections à Mycoplasma pneumoniae en hiver 2023-2024, nous avons assisté à une recrudescence en 2024-2025 des infections à Chlamydia pneumoniae ainsi qu'à pneumocoque avec des tableaux parfois inhabituels. Cette session s'intéresse à tous les aspects récents des pneumopathies typiques ou atypiques d'origine virale, bactérienne ou fongique.

SP18 - Microbiologie clinique

Mycobactéries avec MycoMed

Descriptif à venir.

SP24 - Microbiologie clinique

Campylobacter et Helicobacter dans tous leurs états (avec le GT Helicobacter)

Descriptif à venir.

SP30 - Microbiologie clinique

Microbiome : Il n'y a pas que les bactéries dans la Vie (avec le GT MICMAC)

Le mycobiome, qui fait partie du microbiome humain (incluant le bactériome et le virome), appartient à la biosphère rare de ce dernier. L'étude du mycobiome présente des difficultés techniques spécifiques, quelle que soit l'approche employée : extraction, charge fongique faible, bases de données limitées et non exhaustives, etc. Malgré des charges et diversités fongiques inférieures aux charges et diversités bactériennes, les autres composantes du microbiome (hors bactériome) semblent jouer un rôle dans l'homéostasie humaine, apportant un éclairage nouveau sur la compréhension de certaines maladies et fonctions physiologiques.

SP4 - Microbiologie des aliments

La microbiologie des produits fermentés entre tradition et modernité

Si les boissons et les aliments fermentés existent depuis des millénaires et sont fortement associés à l'identité culturelle et gastronomique des régions productrices; ces dernières années, en lien avec la demande sociétale de naturalité et les transitions alimentaires, on constate un engouement pour les produits fermentés traditionnels mais également un développement de produits fermentés innovants. Ainsi, ces produits d'importance en nutrition humaine et de par leur poids économique évoluent entre tradition et modernité. Les écosystèmes microbiens associé à ces produits contiennent des microorganismes qui interagissent constamment et coévoluent. Dans ce contexte, il est primordial de comprendre comment ces microorganismes impactent la qualité et/ou la sécurité des produits finis, en particulier sur des matrices moins utilisées. Cette session s’ouvre donc à tous les travaux sur les produits fermentés, que ce soit des produits traditionnels ou innovants.

SP10 - Microbiologie des aliments

La sécurité microbiologique des aliments dans le contexte du « One Health »

Dans cette session pourront être soumis tous travaux relatifs aux agents à l’origine de maladies infectieuses, toxiniques et infestations transmises par les aliments, l’antibiorésistance, ainsi que l’impact du changement climatique sur les dangers biologiques. Les aliments contaminés par des agents pathogènes restent une cause majeure de transmission de nombreuses maladies zoonotiques. Le contrôle de notre système alimentaire doit, désormais, se dérouler dans une approche One Health, une seule santé pour les animaux, l’Homme et l’environnement. Pour assurer ce contrôle, il est indispensable d’agir au niveau de toutes les étapes de la chaine alimentaire et de comprendre les interactions entre les agents pathogènes et la complexité des systèmes et matrices qu’ils rencontrent.

SP19 - Microbiologie des aliments / Biotechnologies microbiennes

Interactions microbiennes, maîtrise et modelage des communautés microbiennes : menaces ou nouvelles opportunités ?

Dans cette session pourront être soumis tous travaux portant à la fois sur l’analyse et l’utilisation d’agents de biocontrôle (phages, bactériocines, endolysines), l’exploration conjointe des dynamiques microbiennes et virales, ainsi que sur leurs impacts sur les matrices alimentaires et non alimentaires associées. Cette session cherchera à faire le point sur l’exploration et la compréhension des mécanismes d’interactions microbiennes et leur exploitation pour maîtriser et moduler les communautés dans des contextes variés (cultures pures, co-cultures ou cultures mixtes). Elle sera aussi l’occasion d’échanger sur les défis et opportunités liés à la compréhension et à la modulation des interactions microbiennes dans une perspective de biocontrôle des populations et des écosystèmes.

SP15 - Microbiologie durable

Interaction environnement & One Health

Descriptif à venir.

SP2 - Modélisation / IA

Mathematical modeling and novel quantitative approaches to characterize microbial dynamics

Descriptif à venir.

SP12 - Mycologie

Les infections fongiques superficielles et muqueuses

Les infections fongiques superficielles et muqueuses sont causées par des champignons affectant la peau, les ongles et les muqueuses, comme celles de la bouche et des parties génitales. Elles sont fréquentes Parmi les plus courantes, on retrouve les dermatophytoses (pied d’athlète, teigne) et les candidoses (muguet buccal, mycose vaginale). Ces infections sont fréquentes, généralement bénignes, et souvent traitées par des antifongiques topiques ou systémiques. L’émergence croissante de résistances aux traitements et la disparition de certaines molécules compliquent leur prise en charge. La résistance, particulièrement préoccupante pour certains dermatophytes a été favorisée par l’usage excessif et inapproprié des antifongiques. Elle entraîne des échecs thérapeutiques, des récidives fréquentes et limite les options de traitement.

SP21 - Mycologie

Extracellular vesicles (EVs)

Descriptif à venir.

SP7 - Pathogénie microbienne

Microbial alliances and conflicts: Unravelling the dynamics of polymicrobial infections

Polymicrobial infections represent a growing frontier in microbiology, medicine, and immunology, challenging traditional paradigms of single-pathogen research. These infections arise from the intricate interactions between diverse microbial species, including bacteria, fungi, viruses, and archaea, within shared host environments. The collective behavior of these microbial communities profoundly impacts infection severity, antibiotic resistance, and treatment outcomes, often complicating clinical management and driving the need for innovative therapeutic strategies.
This session aims to bridge disciplines and foster collaboration among researchers and clinicians to unravel the complexities of polymicrobial interactions. By exploring cutting-edge discoveries in microbial communication, competition, and cooperation, as well as host-pathogen dynamics, the session will illuminate how these relationships influence disease progression and resolution. Featuring keynote addresses by a leading expert and a selection of short talks from submitted abstracts, the session will offer a platform for sharing novel insights and technologies. It will advance our understanding of polymicrobial infections and inspire strategies to mitigate their impact on global health, at the forefront of microbiology and medicine.

SP16 - Pathogénie microbienne

The evolving arms race: human vs. microbial pathogens

This session explores pathogenic relationships between microbes and their human host. It is the place for scientists studying human-microbe interactions at the molecular, cellular, tissular and whole-organismal levels to get the latest insights on the strategies employed by pathogens to manipulate host processes, the countermeasures deployed by the human immune system, and the delicate balance that determines the outcome of these interactions.

SP22 - Pathogénie microbienne

Probiotics and pathogens: the yin yang of host-microbe interactions?

This session will explore the latest advancements in host-probiotic interactions, revealing how probiotics influence the host and its microbiota using mechanisms strikingly similar to those of pathogens. By drawing parallels between probiotic manipulation and pathogen-hacking strategies, we aim to uncover new insights into harnessing beneficial microbes for health and disease prevention.

SP28 - Pathogénie microbienne

Impact of climate change on infectious diseases

As the climate undergoes changes, so microbes do too. Rising temperatures, shifting ecosystems, and extreme weather events are creating conditions conducive to the proliferation of new and re-emerging bacterial infections.How do microbial communities respond to a warming world?Can we harness their potential to mitigate environmental challenges while addressing the growing threat of infectious diseases? This study aims to explore the hidden power of microbes in the climate crisis and their dual role in shaping our future.

SP34 - Pathogénie microbienne

Decoding Microbial Mysteries: The Power of Structural Biology

The objective of this session is to highlight the roles of structural biology in fighting microbes. By understanding the atomic details of proteins, researchers can uncover the molecular mechanisms behind microbial processes such as metabolism, infection, and antibiotic resistance. This knowledge enables the design of targeted drugs, innovative vaccines, and engineered microbes for applications in health, agriculture, and biotechnology, offering profound insights into both combating harmful pathogens and harnessing beneficial microbes.

SP1 - Sécurité et sûreté biologiques

Retex sur les contraintes de sécurité et de sûreté biologiques des laboratoires en microbiologie

Dans cette session pourront être présentés tous les travaux relatifs aux questionnements réalisés pour mettre en place et maintenir les aspects pratiques de la sécurité et la sûreté biologiques dans les laboratoires de microbiologie (fondamental, médical, vétérinaire, phytopathogènes...). L’objectif de cette session est de présenter des retours d’expériences dans différents secteurs de la microbiologie pour faire progresser la sécurité globale dans un contexte réglementaire strict tout en restant pragmatique.

SP8 - Virologie fondamentale

Cell invasion by viral genomes, from basic science to therapeutic approaches

The human genome is under constant threat from invasion by mobile genetic elements, such as retroviruses and retrovirus-like elements. In this session we will discuss the strategies used by these elements to invade the nuclear compartment leading in some particular cases to the stable insertion of their genome into host chromatin.

SP17 - Virologie fondamentale

Insects, fascinating intermediaries in the spread of animal and plant viruses

Insects, fascinating intermediaries in the spread of animal and plant viruses. The majority of animal and plant-infecting viruses are transmitted to their host by vectors, including insects, which makes them a critical part of the ecological and epidemiological puzzle, influencing human and plant health in many regions. Understanding these vector/virus interactions provides a foundation for more effective disease controls in animals and plants.

SP23 - Virologie

Pathogènes émergents et ré-émergents : problèmes actuels et à venir

Cette session axée sur les « Pathogènes émergents et ré-émergents » sera l’occasion de discuter des maladies humaines nouvelles qui apparaissent pour la toute première fois et des maladies anciennes qui ré-apparaissent ! En cause … virus, bactéries, champignons, parasites ! Souvent d’origine zoonotique, vous partirez à la découverte de plusieurs de ces agents pathogènes et des maladies dont ils sont responsables. Cette session permettra aussi de mieux connaître les déterminants biologiques de ces agents, leur traitement et les différents outils développés pour leur diagnostic et caractérisation.

SP29 - Virologie

Infections en transplantation

Les infections post-transplantation sont fréquentes, en lien avec l'immunosuppression post-greffe, et exposent le patient à un risque accru de morbidité et mortalité, notamment dans les premiers mois. Les outils diagnostiques conventionnels ne pas toujours suffisants et les possibilités thérapeutiques sont limitées. L'association de biomarqueurs immunologiques aux outils microbiologiques est une stratégie prometteuse pour mieux identifier les patients à risque. Dans cette session, nous présenterons les travaux visant à étudier la physiopathologie de ces infections post greffe, et évaluer de nouveaux biomarqueurs, pour la prise en charge de ces infections.

SP35 - Virologie

Les virus respiratoires ont-ils encore des secrets ?

Malgré des progrès récents dans le diagnostic et la prévention, les infections à virus respiratoires représentent toujours un enjeu de santé publique.
L’analyse des réponses immunes innées et acquises permettent de mieux comprendre la physiopathologie, les mécanismes de réponse inflammatoire, la sévérité et le pronostic et l’étude de la réplication virale et des interactions des protéines virales avec les protéines cellulaires aide à la compréhension de l’évolution de virus et ouvre des perspectives sur le développement de nouvelles stratégies antivirales.
Toutes les communications sur la physiopathologie, l’épidémiologie, le diagnostic et le traitement des infections virales respiratoires seront considérées pour cette session.