Jeudi 8 octobre - Après-midi
Session plénière
SYMPOSIUM
BioMérieux
Changement de salle
Sessions parallèles
SP16 - Pathogénie microbienne +-
Eating to survive: metabolism, immunity, and microbial pathogenesis
(in association with SFI)
SP16 - Pathogénie microbienne
Eating to survive: metabolism, immunity, and microbial pathogenesis
The ability to acquire, sense, and utilize nutrients is fundamental to life, and at the heart of the constant struggle between hosts and microbes. Far from being a passive background process, metabolism actively shapes immune cell function, inflammatory responses, and the strategies used by pathogens to survive and proliferate. In recent years, the field of immunometabolism has revealed that metabolic pathways are tightly integrated with immune signaling, controlling everything from cell fate decisions to antimicrobial defenses. At the same time, pathogenic microorganisms have evolved sophisticated mechanisms to hijack host nutrients, rewire metabolic circuits, and adapt to hostile environments. This metabolic tug-of-war plays a decisive role in infection outcomes, influencing pathogen virulence, immune evasion, and tissue damage. Understanding how metabolism links host immunity and microbial pathogenesis is therefore essential for developing new therapeutic strategies. This session brings together researchers interested in the dynamic interplay between nutrient availability, immune responses, and microbial survival. We will explore how metabolic reprogramming governs immune cell activation, how microbes exploit or manipulate host metabolic resources, and how these interactions shape disease progression.
- SP16-O.1 - How macrophages feed from phagocytosed bacteria
Johan GARAUDE (Immunoconcept, Bordeaux)
+ Selected short oral presentations
- SP16-1 - Feeding on Neighbours: Metabolic Cooperation Between Enterococcus faecalis and Escherichia coli in Anaerobic Biofilms
Brenda LUZ (Department of Microbiology and molecular medicine, Université de Genève, Genève, Suisse) - SP16-2 - Priming of Listeria monocytogenes cytoplasmic virulence program inside replication-permissive vacuoles
Alice LEBRETON (Équipe Dynamique du dialogue bactérie-cellule, Institut de biologie de l’École normale supérieure (IBENS), Université PSL, Paris, France) - SP16-3 - Lipid droplets support Enterococcus faecalis intracellular multiplication in hepatocytes
Cristel ARCHAMBAUD (INRAE, Unite Micalis, Equipe CPE, INRAE, Jouy en Josas, France) - SP16-4 - A story of a frog, a fungus and some bacteria: Siderophore mediated colonisation resistance against chytridiomycosis
Olivier CUNRATH (Biotechnologie et Signalisation Cellulaire, Universite de Strasbourg / CNRS, Strasbourg, France)
SP17 - Virologie
+-
Acute, chronic, latent: multi-faceted viral infections
SP17 - Virologie
Latent infections and neurological diseases
This session will highlight the role of latent or persistent infections in neurological or neurodegenerative diseases. The session will include presentations covering both epidemiological and clinical analyses, as well as in vitro studies aimed at understanding the underlying mechanisms and potential interventions.
- SP17-O.1 - Virus herpétiques et maladie d'Alzheimer : une piste sérieuse pour la prévention ?
Morgane LINARD (Bordeaux)
+ Selected short oral presentations
- SP17-1 - L’administration préventive d’IgIV chez les greffés rénaux à risque diminue l’incidence de virémie BKV
Morgane SOLIS (Laboratoire de Virologie, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France) - SP17-2 - Characterization of broadly neutralizing antibodies against BK polyomavirus identified using a LIBRA-seq-based approach
Sarah MARCHAND (Center for Research in Transplantation and Translational Immunology, UMR 1064, Nantes Université, Nantes, France) - SP17-3 - Apport des marqueurs épigénétiques dans le diagnostic des lymphoproliférations induites par le virus d’Epstein-Barr en contexte d’immunodépression
Vincent GUILLET (Virologie, Hôpital Bichat - Claude Bernard (AP-HP), Paris, France) - SP17-4 - Sustained Type I interferon activity and N-antigenemia form a deleterious feedback loop during severe COVID-19
William MOUTON (Centre International de Recherche en Infectiologie, Lyon, France)
SP18 - Microbiologie clinique +- Parcours formation continue - Session Qualiopi
Quand les microbiotes impactent notre santé
SP18 - Microbiologie clinique
Quand les microbiotes impactent notre santé
Dans cette session pourront être soumis les travaux portant sur les microbiotes humains et plus particulièrement sur laxe intestin-cerveau et les pathologies neuropsychiatriques associées à une dysbiose intestinale.
- SP18-O.1 - Axe microbiote-intestin-cerveau : conséquences physiopathologiques
Vassilia THEODOROU (Toulouse)
+ Communications orales courtes sélectionnées
- SP18-1 - From vaginal to cesarean delivery: a first days neonatal probiotic strategy based on early life gut colonization
Bruna MAITAN SANTOS (INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Paris-Saclay University, Jouy-en-Josas, France) - SP18-2 - Immune surveillance as an organizing axis of gut microbiota structure
Lejla IMAMOVIC (U1016, Institut Cochin, INSERM, University Paris Cité, Paris, France) - SP18-3 - Harnessing the gut microbiome recovery to outcompete vancomycin-resistant Enterococcus
Lionel RIGOTTIER-GOIS (UMR Micalis, INRAE Jouy-en-Josas, Jouy-en-Josas, France) - SP18-4 - Effects of intermittent fasting on the colonic mucus layer
Héloïse CHAT (Laboratory of Molecular Infection Medicine (MIMS), Department of Molecular Biology, Umeå University, UMEÅ, Suède)
SP19 - Biotechnologies microbiennes +-
Les architectes invisibles des cycles biogéochimiques : dynamiques microbiennes, flux de matière et applications biotechnologiques (en association avec l’AFEM)
SP19 - Biotechnologies microbiennes
Les architectes invisibles du cycle de l’azote : dynamiques microbiennes, flux de matière et applications biotechnologiques
Cette session explore le rôle central des micro-organismes dans le cycle de l’azote, en articulant dynamiques écologiques, flux de matière et enjeux fonctionnels. Elle mettra en regard des approches fondamentales et appliquées, des sols aux systèmes biotechnologiques. L’objectif est de relier organisation des communautés microbiennes, contraintes environnementales et performances de transformation de l’azote. La session s’inscrit à l’interface entre écologie microbienne et biotechnologies environnementales.
- SP19-O.1 - Unravelling Microbes-microbe interactions beneath our feet
Laurent PHILIPPOT (INRAe, Dijon) - SP19-O.2
Ahlem FILALI (INRAe, Antony)
+ Communications orales courtes sélectionnées
- SP19-1 - Predictive Modelling of Autotrophic Bioelectrochemical Denitrification: A Random Forest Approach
Anjishnu BISWAS (PROSE, Université Paris Saclay, INRAE, Antony, France) - SP19-2 - Criblage fluorescent de déhalogénases : faire la lumière sur les futures solutions de bioremédiation
Marnie MALLET (MAP UMR 5240, Equipe M2E, INSA Lyon, UCB Lyon 1, CNRS, Villeurbanne, France) - SP19-3 - Temporal control of heterologous hyaluronic acid biosynthesis in Bacillus subtilis reveals a route to high-yield production without early growth burden
Nazanin MEHRZAD (Biotechnical Faculty, University of Ljubljana, Ljubljana, Slovénie)
SP20 - Antimicrobiens
+-
How studying antimicrobial modes of action and resistance raises fundamental questions in microbiology and the other way round
SP20 - Antimicrobiens
How studying antimicrobial modes of action and resistance raises fundamental questions in microbiology and the other way round
The study of antimicrobial modes of action and resistance mechanisms directly interrogates fundamental processes of microbial cell biology. This session aims to explore these interactions addressing these questions at the molecular, cellular, and evolutionary levels, and encourages studies linking mechanistic insights with core microbiological concepts.
- SP20-O.1 - Hidden doors to drug entry: uridine-driven transport potentiates aminoglycosides
Zeynep BAHAROGLU (Institut Pasteur, Paris)
+ Selected short oral presentations
- SP20-1 - Structural and functional validation of bacterial trans-translation as a druggable antimicrobial target
Andrés CORRAL LUGO (Contrôle qualité de la synthèse protéique, IGDR-Université de Rennes, Rennes, France) - SP20-2 - Rational Approach Guided by Structural Biology for the Design of Peptidomimetics Inhibiting Efflux Pumps in Pseudomonas aeruginosa
Isabelle BROUTIN (Laboratoire CiTCoM, Université Paris Cité/CNRS, Paris, France) - SP20-3 - Spatial analysis of Pseudomonas aeruginosa biofilm physiology and antimicrobial tolerance
Marie DRONIOU (Laboratoire Polymères, Biopolymères et Surfaces UMR 6270, Université de Rouen, Mont-Saint-Aignan, France) - SP20-4 - Development of novel microbicidal system using enzyme ccVHPO1 from the red algae Chondrus crispus to fight antibioresistance
Valentin AMALRIC (Centre de Recherche Paul Pascal, CNRS, Pessac, France)
SP21 - Microbiologie durable +-
Changement climatique : de la vulnérabilités des écosystèmes à celle des systèmes de santé
SP21 - Microbiologie durable
Changement climatique : de la vulnérabilités des écosystèmes à celle des systèmes de santé
Le changement climatique modifie les dynamiques microbiennes et expose à de nouvelles vulnérabilités les établissements de santé et les industries de la santé. L’émergence de pathogènes, la pression sur les résistances aux anti-infectieux, la fragilisation des infrastructures et des chaînes de production : les risques sanitaires s’intensifient. Cette session vise à identifier ces vulnérabilités systémiques et à proposer des stratégies d’adaptation pour renforcer la résilience des systèmes de soins et de production face aux pressions climatiques.
- SP21-O.1 - Le système de santé est-il vulnérable face au changement climatique et aux approvisionnements en énergie fossile ?
Baptiste VERNEUIL (Shift Project, Paris)
+ Communications orales courtes sélectionnées
- SP21-1 - Leveraging Large Language Models to Capture Emerging Food Practices Relevant to Microbial Risk Assessment under Climate Change
Estelle CHAIX (DER / UERALIM, ANSES, Maisons-Alfort, France) - SP21-2 - Évaluation de l’empreinte environnementale des tests de biologie moléculaire par Analyse du Cycle de Vie (ACV)
Léa LUCIANI (Service de virologie aigue et tropicale, Assistance Publique Hôpitaux de Marseille, Marseille, France) - SP21-3 - Climate change, evolution of Buruli ulcer epidemiological features, disappearance of environmental Mycobacterium ulcerans, and evidence for alternative reservoirs in Buruli ulcer transmission
Matthieu EVEILLARD (Département de Biologie des agents infectieux, CHU Angers, Angers, France) - SP21-4 - Climate Change and Consumer Behavior: Identifying the Most Risky Practices from a Microbiological Perspective
Estelle CHAIX (French Agency for Food, Environmental and Occupational Health & Safety, Maisons-Alfort, France)
Forum 2 & 3 - R-2Pause café - Visite de l’exposition - Posters
Forum 2 & 3 - R-2SESSION POSTERS affichés 1 - Numéros impairs
SESSION POSTERS commentés 1
Voir la liste des posters commentés +-
Antimicrobiens
- PC1-P01 - Antibiotic is not only about using less: the WHO access classification applied to France 2019/2024
Pierre LEROUX (Aix Marseille, Marseille, France) - PC1-P02 - Conjugaison bactérienne : impact des modifications gravitaires
Catherine CAILLIEZ-GRIMAL (Université de Lorraine, Vandoeuvre-lès-nancy, France) - PC1-P03 - Environmental dissemination of the SXTMO10 mobile genetic element in an experimental trout farming setup
Hélène GUILLOTEAU (UMR7564 (LCPME), CNRS-Université de Lorraine, vandoeuvre-les-Nancy, France)
Epidémiologie et génomique des populations
- PC1-P04 - Quantifying the mechanisms of vaccine-induced serotype replacement in Streptococcus pneumoniae using genome-informed modelling
Zein ASSAD (EPIC, IAME Inserm UMR 1137, Paris, France)
Microbiologie clinique
- PC1-P05 - Titre à venir
Orateur à venir - PC1-P06 - Titre à venir
Orateur à venir - PC1-P07 - Adaptation précoce de l'antibioprophylaxie en transplantation pulmonaire grâce au FilmArray Pneumonia Panel Plus® réalisé sur le lavage broncho-alvéolaire du donneur
Mathilde RENIER (Department of Clinical Microbiology, Hôpitaux Paris Saint-Joseph et Marie Lannelongue, Paris, France) - PC1-P08 - Microbiote prostatique et dysbiose associée au cancer de la prostate
Romain LOTTE (Laboratoire de Bactériologie, CHU de Nice, Hôpital Archet 2, Nice, France)
Sessions parallèles
SP22 - Pathogénie microbienne +-
Microbial resilience: Evolutionary strategies of pathogens under stress
SP22 - Pathogénie microbienne
Microbial resilience: evolutionary strategies of pathogens under stress
Pathogens, like bacteria, fungi, viruses, and parasites, possess a variety of mechanisms that allow them to thrive even in the face of stressors like temperature shifts, antimicrobial agents, nutrient scarcity, oxidative stress, and immune responses.Understanding the emergence, transmission and maintenance of genetic lineages of pathogenic bacteria and their role in infectious diseases. General microbial ecology and evolution, by combining advanced statistical methods with large-scale genome sequencing and experiments to advance understanding about the drivers of success in bacterial populations.
- SP22-O.1 - Molecular evolution of fungal plant pathogen effectors
Thorsten LANGNER (Max Planck Institute for Biology, Tuebingen, Germany)
+ Selected short oral presentations
- SP22-1 - Mycobacterial surface shedding drives bystander cell responses during early intracellular infection
Mélanie FOULON (Department of Biochemistry, University of Geneva, Geneva, Suisse) - SP22-2 - The role of stringent response in S. aureus intracellular lifestyle
Martin FAYOLLE (Laboratoire des agents infectieux et d'hygiène, CHU Saint-Etienne, Saint-Priest-En-Jarez, France) - SP22-3 - Networked Virulence under Constraint: How Dickeya dadantii Integrates Environmental Signals to Infect Plants
Sébastien BONTEMPS-GALLO (Univ. Lille, CNRS, Inserm, CHU Lille, Institut Pasteur de Lille, U1019 UMR 9017, Center for Infection and Immunity of Lille, Lille, France) - SP22-4 - Oxidative stress response and its regulation in Leptospira species of intermediate virulence
Anne-Emmanuelle ROUX (Biologie des spirochètes, Institut Pasteur, Paris, France)
SP23 - Virologie fondamentale et clinique +-
Viruses: innovatives concepts & tools
SP23 - Virologie fondamentale et clinique
Viruses, innovative tools for health
A session that takes a step aside to focus on the use of viruses (including phages) and host-virus interactions to develop innovative strategies in vaccinology, anti-tumor therapeutics and anti-infectious therapies.
- SP23-O.1
Jean-François FONTENEAU (Nantes)
+ Selected short oral presentations
- SP23-1 - Transcriptomic vs Proteomic Nasal Host based Markers: Comparative Evaluation for Respiratory Viral Infection Diagnosis in Nasopharyngeal Swabs
Caroline DUPRÉ (CIRI, UCBL, Lyon, France) - SP23-2 - How the Emergence of SARS-CoV-2 Shaped Virus-Virus Interactions: Insights from a Large-Scale U.S. Study (2018-2025)
Olivier TERRIER (CIRI, Lyon, France) - SP23-3 - Les organoïdes bronchiques personnalisés comme modèle d’étude du remodelage tissulaire asthmatique en condition d’infection virale
Elodie ALESSANDRI-GRADT (DYNAMICURE UMR 1311 INSERM, Normandie Univ, Univ Rouen Normandie, Université de Caen, Normandie, Rouen, France) - SP23-4 - Computational Modeling and Immunoinformatics-Based Design of a Advanced Multi-Epitope Vaccine Against Mpox Virus (MPXV) Clade IIb
Othmane LAASER (Sciences and Engineering of Biomedicals, Biophysics and Health Laboratory, Higher Institute of Health Sciences - Hassan First University, Settat, Maroc)
SP24 - Microbiologie clinique +- Parcours formation continue - Session Qualiopi
IST et dysbiose
SP24 - Microbiologie clinique
IST et dysbiose
Cette session s’intéresse à toutes les nouveautés épidémiologiques, diagnostiques, de résistance ou de traitement concernant les infections sexuellement transmissibles bactériennes, virales ou parasitaires et le microbiote ou les dysbioses génitales.
- SP24-O.1 - Du nouveau chez le gono
Béatrice BERÇOT (Paris)
+ Communications orales courtes sélectionnées
- SP24-1 - Key vaginal microbiota species are impacted by chemicals detected in menstrual products
Anaïs BLACHE (Université de Montpellier, ExposUM, Montpellier, France) - SP24-2 - Diffusion de clones de Mycoplasma genitalium multi-résistants et spécifiques de certains territoires en France métropolitaine et d’Outre-mer
Sabine PEREYRE (Laboratoire de Bactériologie, Université de Bordeaux - CHU de Bordeaux - CNR des IST bactériennes, Bordeaux, France) - SP24-3 - Émergence d’infections cutanées dues à Dermatophilus congolensis avec suspicion de transmission sexuelle parmi les hommes ayant des relations sexuelles avec les hommes
Matthieu DEGREZE (Institut des Agents Infectieux, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France) - SP24-4 - Microbiote vaginal et colonisation à Streptococcus agalactiae : existe-t-il un environnement à risque plus élevé d’infection materno-fœtale ?
Brice LE GALLOU (Bactériologie, CHU Tours - Hôpital Bretonneau, Tours, France)
SP25 - Microbiologie des aliments +-
Sécurité microbiologique des aliments dans le contexte du One Health
SP25 - Microbiologie des aliments
Sécurité microbiologique des aliments dans le contexte du One Health
Dans cette session pourront être soumis tous travaux portant sur les agents responsables de maladies infectieuses, toxiniques et infestations parasitaires transmises par les aliments, l'antibiorésistance, ainsi que sur l'impact du changement climatique sur les dangers biologiques. Les aliments contaminés par des agents pathogènes demeurent une source majeure de transmission de nombreuses maladies zoonotiques. Le contrôle des systèmes alimentaires doit désormais s’inscrire dans une approche One Health, intégrant la santé animale, humaine et environnementale. Les contributions attendues pourront concerner l’ensemble des étapes de la chaîne alimentaire et viser à mieux comprendre les interactions entre les agents pathogènes et la complexité des systèmes et matrices alimentaires.
- SP25-O.1 - One Health surveillance of antimicrobial resistance: from data to action
Lucie COLLINEAU (Anses, Lyon)
+ Communications orales courtes sélectionnées
- SP25-1 - Réutilisation des eaux usées traitées pour l'agriculture et dissémination de pathogènes dans la chaîne alimentaire et l’environnement : une étude One Health de Clostridioides difficile
Alexandre MROZINSKI (Agroécologie, INRAE, Dijon, France) - SP25-2 - Attribution de source de Clostridium perfringens par le génome accessoire : apports et limites dans une approche One Health
Olivier FIRMESSE (Laboratoire de sécurité des aliments, ANSES, Maisons-Alfort, France) - SP25-3 - Analysis of the genetic and phylogenetic context of Escherichia coli O77g:H18 associated with HUS in France
Sabine DELANNOY (Laboratoire de sécurité des aliments, Anses, Maisons-Alfort, France) - SP25-4 - Biomarqueurs fluorescents pour le suivi de la reprise de croissance et de la virulence de Bacillus cereus émétique dans les matrices laitières après un stress technologique
Bastien DELBREIL (Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale, INRAE, Avignon Université, Avignon, France) - SP25-5 - A multidisciplinary framework for risk assessment of mycotoxins in moldy foods supporting consumer safety and food waste reduction
Camille MARCHAL (Laboratoire Universitaire de Biodiversité et d’Ecologie Microbienne (LUBEM), Univ Brest INRAE, Plouzané, France)
SP26 -
Antimicrobiens
+-
Antimicrobial dissemination: horizontal gene transfer & mobile genetic elements
SP26 - Antimicrobiens
Antimicrobial dissemination: horizontal gene transfer & mobile genetic elements
The dissemination of antimicrobial resistance relies on DNA exchanges within bacterial communities through horizontal gene transfer. Mobile genetic elements act as molecular vehicles that enable resistance genes to rapidly spread across species and environments. Understanding how these elements and the mechanisms controlling DNA transfer and acquisition operate is key to explaining—and ultimately limiting—the global spread of antimicrobial resistance.
- SP26-O.1 - Mobile genetic elements shed light on the function of natural transformation and its role in AMR spread
Xavier CHARPENTIER (CIRI, Lyon)
+ Selected short oral presentations
- SP26-1 - Chromosomal jumbo islands spreading antimicrobial resistance, host-adaptation factors and defense systems in E. coli and Salmonella: a novel phage satellite family of nucleus-forming Chimalliviridae
Aurore ROSSIGNOL (UMR ISP, INRAE, Université de Tours, Nouzilly, France) - SP26-2 - Epidemic spread of blaNDM genes: clonal and plasmid diffusion dynamics within the Normandy hospital network
Camille COTET (EERA, Institut Pasteur, Paris, France) - SP26-3 - Beyond the binary: large-scale genomic analysis reveals a continuum of integron mobility and cassette exchange across bacteria
Tabea ELSENER (Microbial Evolutionary Genomics, Institut Pasteur, PARIS, France) - SP26-4 - Plasmid sharing drives carbapenem resistance dissemination across environmental and clinical compartments
Vahiniaina ANDRIAMANGA (HSM, Université de Montpellier, CNRS, IRD, Montpellier, France)
SP27 - Environnement
+-
Environmental microbiome
SP27 - Environnement
Air and space microbiology
This session will be broadly dedicated to fundamental and practical aspects of air and space microbiology. This can cover a wide range of microbiological areas such as aerial dissemination of microbes and genes (e.g. through aerosols for instance), as well as the air and space microbiomes, or even the physiological aspects of microbes transiting in such environmental compartments.
- SP27-O.1 - The aeromicrobiome: microbial life, transport and selection in the atmosphere
Pierre AMATO (Laboratoire Microorganismes, Génome et Environnement (LMGE), UMR6023 CNRS UCA, Clermont-Ferrand)
+ Selected short oral presentations
- SP27-1 - Integrating coastal microbiome observations for human, oyster and environmental protection
Michèle GOURMELON (DYNECO/PELAGOS, IFREMER, Plouzané, France) - SP27-2 - Analysis of water sources and treatment plants reveals multi-kingdown community changes, uncharacterized Legionella diversity and persistence of opportunistic pathogens
Pierre FOUCAULT (Biology of Intracellular Bacteria, Pasteur Institute, Paris, France) - SP27-3 - Uncovering the hidden role of storage as a driver of microbiological risks in water reuse
Emma BOUSQUET (BioSyM (Bioprocédés et Systèmes Microbiens), LGC, Toulouse, France) - SP27-4 - HAO project: a combination between native plants and siderophore for the remediation of a South Pacific atoll
Séverine LOPEZ (BSC, Université de Strasbourg / CNRS, Illkirch-Graffenstaden, France)
Cocktail dînatoire
03/04/2026