SFM 2026

7-9 octobre 2026 - Centre de Congrès de Lyon

Bandeau - SFM 2026
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Vendredi 9 octobre - Matinée

07:45-08:30

Foyer Forum 2 & 3 - R-2Accueil des participants


Sessions parallèles
08:30-10:00
SP28 - Pathogénie microbienne +-

Inherited heterogeneity in pathogenic bacteria

SP28 - Pathogénie microbienne

Inherited heterogeneity in pathogenic bacteria

Inherited heterogeneity in pathogenic bacteria is crucial for their survival and ability to cause infection, as it allows them to adapt to fluctuating environments and evade the host immune system, with strategies such as immune evasion through surface structure alterations, division of labor among cells for different functions like growth or biofilm formation, bet-hedging to ensure some cells survive under stress, and the ability to colonize different surfaces in the host, all of which contribute to their persistence and pathogenicity, and these mechanisms of phenotypic inheritance include phase variation through DNA inversion, DNA methylation to regulate virulence gene expression, and positive feedback loops that reinforce the stable expression of certain traits, ensuring bacterial populations can thrive under selective pressures and maintain infection over time.


  • SP28-O.1 - Uncovering phenotypic inheritance from single cells with Microcolony-seq
    Ilan ROSENSHINE (University of Jerusalem , Israel)

+ Selected short oral presentations

  • SP28-1 - Heterogeneous growth and relapse dynamics of intracellular pathogens in macrophages
    Iris DADOLE (Team PERSIST, Centre international de recherche en infectiologie (CIRI), Lyon, France)
  • SP28-2 - A pleiotropic sRNA provides a privileged mutational route to social cheating during bacterial plant infection
    Erwan GUEGUEN (MAP UMR5240, Université Claude Bernard Lyon I, Villeurbanne, Cedex)
  • SP28-3 - Abstract: Unprecedented Dock–Lock–Latch Adhesion of Vimentin to Staphylococcus aureus
    Manon DECHÊNE-TEMPIER (nano Biophysics - nBIO, Louvain Institute of Biomolecular Science and Technology (LIBST), UCL, Louvain-la-Neuve, Belgique)
  • SP28-4 - Beyond contact: new insights into colibactin's range of action and stability
    Arthur COMBEAU (UMR1220 Inserm/Université Paul Sabatier/ENVT/INRAE, IRSD, Toulouse, France)

08:30-10:00
SP29 - Virologie clinique +-

Epidémies mondiales et nationales : quand les agents infectieux sont toujours bien présents !

SP29 - Virologie clinique

Epidémies mondiales et nationales : quand les agents infectieux sont toujours bien présents !

Cette session SPILF–SFM abordera la gestion clinique des épidémies, qu’elles soient virales, bactériennes ou parasitaires et fongiques, illustrées par des exemples récents de pathogènes émergents. Face à des agents infectieux toujours bien présents et en constante évolution, elle proposera un éclairage sur les défis diagnostiques, thérapeutiques et organisationnels rencontrés en pratique. À travers des approches cliniques, épidémiologiques et de terrain, cette session permettra de mieux comprendre comment anticiper, reconnaître et prendre en charge ces menaces, qu’elles soient globales ou nationales.


  • SP29-O.1
    Thomas PERPOINT (Hospices Civils de Lyon)

+ Communications orales courtes sélectionnées

  • SP29-1 - Spatial heterogeneity in RSV-SARI incidence in infant at the city level: sociodemographic and epidemiological determinants of urban hotspots and coldspots, Lyon, France, 2012–2025
    Jean-Sébastien CASALEGNO (Institut des Agents Infectieux, Laboratoire de Virologie, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France)
  • SP29-2 - Un an de surveillance des entérovirus dans les eaux usées : détection anticipée de l’épidémie à EV-D68 en 2024
    Ophélie PERRUCHE (Laboratoire de Virologie, CHU de Clermont-Ferrand, Clermont-Ferrand, France)
  • SP29-3 - Coronavirus humains saisonniers : une charge hospitalière sous-estimée ?
    Camille DELFORGE (Département de Virologie, CHU de Caen, Caen, France)
  • SP29-4 - Vagues épidémiques multiples dues à des souches inhabituelles de rotavirus G1P[6] et G12P[6] dans un service de néonatalogie
    Aurelie SCHNURIGER (Virologie, Sorbonne Université et APHP, Paris, France)

08:30-10:00
SP30 - Microbiologie clinique +- Parcours formation continue - Session Qualiopi

Logo COL_BVH"Nouveaux" outils pour le diagnostic et interprétation des données
(en association avec le Col.BVH)

SP30 - Microbiologie clinique

"Nouveaux" outils pour le diagnostic et interprétation des données

Cette session s'intéresse à toutes les applications diagnostiques, de résistance, épidémiologiques, d'identification de pathogènes, de compréhension des infections utilisant les approches NGS et notamment amplicons-NGS.


  • SP30-O.1 - Diagnostic et investigations des légionelloses : nouveaux éclairages apportés par le NGS
    Ghislaine DESCOURS (Hospices Civils de Lyon)

+ Communications orales courtes sélectionnées

  • SP30-1 - Validation par analyse NGS mutagénèse dirigée de mutations décrites comme associées la résistance au métronidazole chez Helicobacter pylori
    Alexandra HERVÉ (Inserm U1070 PHAR2, Poitiers, France)
  • SP30-2 - Microbiote intestinal : et si tout dépendait de la méthode ?
    Flora NOLENT (Dpt Microbiologie et Maladies infectieuses, U. Bactériologie, IRBA, Brétigny-sur-Orge, France)
  • SP30-3 - Surveillance de la résistance des virus Influenza aux antiviraux : ce qui a changé avec le séquençage NGS en routine (CNR-HCL 2013-2024)
    Vanessa ESCURET (CNR des Virus des Infections Respiratoires/Laboratoire de Virologie, Hospices Civils de Lyon / Institut des Agents Infectieux, Lyon, France)
  • SP30-4 - Automated bioinformatic pipeline for improved tuberculosis management and outbreak response
    Charlotte GENESTET (Laboratoire de bactériologie, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France)

08:30-10:00
SP31 - Microbiologie des aliments +-

Food microorganisms: resistant or tolerant?

SP31 - Microbiologie des aliments

Food microorganisms: resistant or tolerant?

This session is open to all studies related to the effect of antimicrobials (antibiotics, biocides, etc.) on food microorganisms, as well as their use in food production.


  • SP31-O.1 - Foodborne antibiotics enrich human gut microbiota with pathogens producing extended-spectrum β-lactamases and carbapenemases
    Didier HOCQUET (Université Marie et Louis Pasteur, Besançon)

+ Selected short oral presentations

  • SP31-1 - High throughput qPCR analyses suggest that Enterobacterales of French sheep and cow cheese rarely carry genes conferring resistances to critically important antibiotics for human medicine
    Mai-Lan TRAN (Unité COLiPATH Plateforme IdentyPath Laboratoire de sécurité des aliments, ANSES, Maisons-Alfort, France)
  • SP31-2 - Acetic acid adaptation in the Bacillus cereus group: impact on pH growth limits, tolerance, and resistance
    Léa BELLOT (Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Écologie Microbienne, Univ Brest, Quimper, France)
  • SP31-3 - Une rupture technologique dans la lutte contre les biofilms : l’alliance enzymes-bactériocine pour un contrôle efficace de Listeria monocytogenes
    Laurent DELHALLE (Food Science Department, University of Liège, Liège, Belgique)
  • SP31-4 - Efficacité de traitements biocides et UV pour la désinfection de moisissures d’altération dans l’industrie laitière
    Mélanie CADORET (LUBEM UR 3882 / USC INRAE 1504, Université de Bretagne Occidentale, Plouzané, France)
  • SP31-5 - Titre à venir
    Orateur à venir

08:30-10:00
SP32 - Antimicrobiens +-

New antimicrobial strategies

SP32 - Antimicrobiens

New antimicrobial strategies

It is well established that bacteria can develop resistance to antibiotics, which represents a major and growing public health concern. A key policy to reverse this trend is to restrict the indiscriminate use of antibiotics. However, the emergence of resistant microbes is inevitable. Therefore, it is essential to continually develop new strategies and antimicrobial compounds. The purpose of this session is to present some ongoing efforts to identify potential new strategies. It will also highlight the molecular aspects of the promising cellular processes that could be targeted.


  • SP32-O.1 - A structural journey into antibiotic resistance and bacterial new targets
    Elise Kaplan (Lyon)

+ Selected short oral presentations

  • SP32-1 - 3A11 induces thiol stress, metabolic dysfunction and copper homeostasis perturbation in Gram-positive pathogens
    Benjamin DURAND (CIRI - StaPath, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France)
  • SP32-2 - ASO (antisense oligomer) based mRNA silencing as an antimicrobial strategy against Staphylococcus aureus
    Gauthier ROY (Institute for Molecular Infection Biology (IMIB), Würzburg, Allemagne)
  • SP32-3 - From Nebuliser to Lung: Preserving Infectious Bacteriophages for Respiratory Therapy
    Hadrien MALLET (Pharmacy Department, FRIPHARM, Hospices Civils de Lyon, Edouard Herriot Hospital, Lyon, France)
  • SP32-4 - Optimisation of bio-inspired antimicrobial peptides toward novel antimicrobial therapeutics
    Lucie BASTIEN (Univ. Grenoble Alpes, CNRS, CEA, Grenoble INP, IRIG, SyMMES, Grenoble, France)

08:30-10:00
SP33 - Environnement +-

One health

SP33 - Environnement

One health

The "One Health" session of Environmental Microbiology aims to address all aspects linking microorganisms to human, animal, and environmental health. This includes mechanisms shared across all living systems that facilitate the transfer of microorganisms, for example, from humans to animals in the case of zoonoses. It also includes those that, conversely, enable comprehensive control over microorganisms, such as innate immunity.


  • SP33-O.1 - What phage-bacteria interactions teach us about innate immunity
    François ROUSSET (CIRI, Lyon)

+ Selected short oral presentations

  • SP33-1 - One Health genomics of Acinetobacter baumannii reveals sector-specific lineages and permeable ecological barriers
    Maria-Halima LAABERKI (VetAgro Sup, Marcy l'étoile, France)
  • SP33-2 - Biodiversity, Ecological Interfaces and Hantavirus Circulation: A Multi-Scale Approach to Zoonotic Risk
    Céline ARNATHAU (MIVEGEC, CNRS, Montpellier, France)
  • SP33-3 - Diversity, ecology, epidemiology, and Leptospira reservoirs
    Victoria CARCAUZON (CNRS UMR, Unité de Biologie des Spirochetes, Institut pasteur, Paris, France)
  • SP33-4 - Substantial intraspecies variations in bat innate immunity suggest ongoing selective pressures shaping inter-interindividual heterogeneity in antiviral defense
    Emeline ESNOUF (MIVEGEC, IRD, Montpellier, France)

10:00-10:15

Forum 2 & 3 - R-2Pause café - Visite de l’exposition - Posters


10:15-11:00

Forum 2 & 3 - R-2SESSION POSTERS affichés 2 - Numéros pairs


10:15-11:00

SESSION POSTERS commentés 2

Voir la liste des posters commentés +-
Pathogénie microbienne
  • PC2-P01 - Cyclic fatty acids in Clostridioides difficile cyclic life
    Claire MORVAN (Laboratoire Pathogenèse des Bactéries Anaérobie, Université Paris Cité - Institut Pasteur, Paris, France)
  • PC2-P02 - How the digestive system shape bacterial metabolism and physiology?
    Arnaud FICHANT (Centre for Organismal Studies, Heidelberg University, Heidelberg, Allemagne)
Microbiologie des aliments
  • PC2-P03 - Molecular and environmental indicators of Listeria monocytogenes persistence in food processing facilities: a multi sector approach
    Thomas BRAUGE (Laboratory for food safety, SANAQUA Unit, Anses, Boulogne sur Mer, France)
Biodiversité et évolution
  • PC2-P04 - Evolutionary bases of bacteria-phage interactions in natural populations
    Charles BERNARD (Institut Pasteur, Paris, France)
Virologie clinique
  • PC2-P05 - High Seroprevalence and Silent Virus Shedding during an Equine Viral Arteritis Outbreak in Breeding Stallions
    Anthony MADELINE (LSAn site de Normandie, Anses, Goustranville, France)
  • PC2-P06 - Titre à venir
    Orateur à venir
Biotechnologies microbiennes
  • PC2-P07 - Titre à venir
    Orateur à venir
Environnement
  • PC2-P08 - Phenotypic and genotypic study of bacterial evolution and antibiotic resistance under chronic exposure to pesticides
    Ibrahima SOW (MEPHI, IHU-Méditerranée Infection, Aix-Marseille Université, Marseille, France)

Sessions plénières
11:00-11:40
SYMPOSIUM

11:40-12:25
Conférence plénière
+-

Alexandre MÉRIEUX

Descriptif à venir.


Alexandre MÉRIEUX (BioMérieux, Marcy-l'Étoile)

  • Parcours Microbiologique d'une famille

12:25-12:40
Annonce des prix

12:40-13:55

Forum 2 & 3 - R-2Déjeuner - Visite de l’exposition - Posters

 

03/04/2026