SFM 2019

Parole aux industriels

Modérateurs : Gérard Lina et Jean-Louis Herrmann

Amphi. Gaston Berger - Niveau S2

• MP Biomedicals
  Flexibility in Sample Preparation - Daniel Weissbart
• Acea Biosciences
  Des instruments dédiés à la détection, la quantification et l’analyse de
  microbes ainsi que de leur interactions - Pascale Daou et Jérome Darakdjian
• Bruker / Biocentric
  Bruker & Biocentric, un an déjà - Renaud Joly
• I&L Biosystems
  Des analyses microbiologiques aux modèles d’étude des biofilms, interactions hôte-pathogène… - Stéphane Pinhal
• bioMérieux
  BIOMÉRIEUX EPISEQ CS : le typage moléculaire en un seul clic - Benjamin Moingeon

SP1.5 - Antimicrobial agents

New immunotherapeutic approaches (in association with SFI)

Chairs: Mickaël Riou and Claude Leclerc

Salle 1 - Niveau S3

• Dendritic cell targeting of viral antigens in DNA vaccination in pig and ruminants
  Isabelle Schwartz (INRA, Jouy-en-Josas)
• Novel approaches boosting innate immunity against Pseudomonas aeruginosa
  Ignacio Caballero (INRA – Centre Val de Loire, Nouzilly)
• Towards the development of a tetravalent synthetic carbohydrate-based glycoconjugate vaccine against shigellosis
  Armelle Phalipon (Institut Pasteur, Paris)

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SP2.3 - Microbiologie des aliments

Des facteurs de risques et des échanges

Modératrices : Isabelle Villena et Sabine Leroy

Salle Louis Armand Est - Niveau S3

• La résistance aux antibiotiques des bactéries des aliments fermentés
  Sabine Leroy (INRA, Clermont Ferrand)

Communications orales courtes

• Role of the exporter PptAB in secretion of pheromones in Streptococcus thermophilus
  Abarna Lingeswaran - ComBac, Micalis,INRA, Jouy-en-Josas, France
• The mobilome; a major contributor to Escherichia coli stx2-positive O26:H11 strains intra-serotype diversity
  Sabine Delannoy - Laboratoire de sécurité des aliments, Anses, Maisons-Alfort, France
• Exfoliative toxin E, a new Staphylococcus aureus virulence factor with host-specific activity
  Yves Le Loir - UMR1253 STLO, INRA, Rennes, France

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SP3.3 - Microbiote et toxicologie

Microbiote et alimentation (en association avec la STCM)

Modératrices : Saadia Kerdine-Römer et Marie-Chantal Canivenc-Lavier

Salle Louis Armand Ouest - Niveau S3

• Impact du microbiote sur l’allergie alimentaire aux protéines de lait de vache chez les nourrissons
  Anne-judith Waligora-Dupriet (Université Paris Descartes, Paris)
• Le microbiote intestinal : une nouvelle source de probiotiques ?
  Luis Bermudez-Humaran (INRA, Jouy-en-Josas)

Communications orales courtes

• Fermented milks, using Lactobacillus casei or Propionibacterium freudenreichii, prevent mucositis, a side effect of chemotherapy, in mice
  Gwénaël Jan - UMR STLO, INRA, Rennes, France
• Impact de l’indole, métabolite bactérien dérivé du tryptophane, sur l’activité mitochondriale, l’expression de la cytokine pro-inflammatoire IL-8 et l’intégrité de l’ADN dans un modèle de cellules épithéliales coliques
  Lucie Armand - AgroParisTech, Paris, France
• Dysbiose intestinale et phénotype pro-allergique : décryptage du lien entre microbiote intestinal et allergie cutanée
  Émilie Plantamura - MaaT Pharma, Lyon, France

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SP1.6 - Antimicrobial agents

Antimicrobial peptides

Chairs: Vincent Cattoir and Yann Héchard

Salle 3 - Niveau S3

• Physiological and therapeutic roles of antimicrobial peptides
  Sylvie Rebuffat (Muséum national d’Histoire naturelle, Paris)

Short oral presentations

• PARAGEN: a standardized synthetic gene library to produce antimicrobial peptides
  Philippe Gabant - Syngulon, Seraing, Belgique
• Antibacterial and anti-biofilm properties of peptoids cationic amphipatic AMP mimics
  Christiane Forestier - UMR CNRS 6023 LMGE, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France
• New antibiofilm mechanism of action, matrix anti-assembly (MAA), displayed by red pepper peptide
  Rafael Gomes Von Borowski - UMR 6290 / RBS, Univ. Rennes1 / CNRS / IGDR, Rennes, France

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SP4.3 - Microbiologie clinique

Miscellanées (en association avec le Col.BVH)

Modérateurs : Christian Cattoen et Alain Gravet

Salle 4 - Niveau S3

• Suivi des épisodes bactériémiques dans des établissements hospitaliers des Hauts de France
  Christian Cattoen (Centre hospitalier, Valenciennes)
• Évaluation de la qualité de l’antibiogramme dans le réseau Collège de Bactériologie Virologie Hygiène des hôpitaux (Col.BVH) : des années d’expérience
  Hubert Chardon (Centre hospitalier, Aix-en-Provence)
• Réseau méningite du Col.BVH : quels germes ?, quelles pathologies ?, évolution sur 30 ans
  Odile Bellon (Centre hospitalier, Brignoles)

Communication orale courte

• Identification rapide des hémocultures par spectrométrie de masse (MALDI-TOF) et leur impact sur la consommation d’antibiotiques dans un hôpital général
  Mario Vilaró - Laboratoire de Microbiologie, Hospital Privado de Córdoba-Argentina, Córdoba, Argentine

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SP5.3 - Microbial pathogenesis and fundamental microbiology

Organs-on-chips, a new paradigm

Chairs: Gérard Lina and Eric Oswald

Salle 2 - Niveau S3

• A bioengineered human Organ-on-Chip reveals the intestinal microenvironment and mechanical forces are critical for Shigella infection
  Nathalie Sauvonnet (Institut Pasteur, Paris)

Short oral presentations

• Biological control of Aspergillus niger through bacterial oxalotrophy in-vitro and in a Lung-on-a-chip microfluidic system
  Fabio Palmieri - Laboratoire de Microbiologie, Université de Neuchâtel, Neuchâtel, Suisse
• Colorectal cancer associated-E. coli induce the emergence of chemotherapy-resistant stem cell-like phenotype of host cells
  Guillaume Dalmasso - Inserm U1071, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France
• Use of the Enteroid Model for Assessing the Persistence of Infectious Human Noroviruses in the Environment
  Marion Desdouits - Labo. Santé Environnement Microbiologie, IFREMER, Nantes, France

SP7.1 - Microbiologie industrielle et biotechnologie

CO₂ : de la production anthropique à la fixation par les micro-organismes (en association avec l’AFEM/FFBiotech)

Modératrices : Marielle Bouix et Julie Leloup

Salle 3 - Niveau S3

• Le rôle de la pompe biologique marine dans les flux de CO₂
  Ludwig Jardillier (Université Paris-Sud, Orsay)
• Ingénierie métabolique et ingénierie des réacteurs pour la production de molécules à partir du CO₂
  Stéphane Guillouet (INSA - LISBP, Toulouse)
• Produce methane and biomolecules of interest from carbon dioxide
  Etienne Paul (INSA, Toulouse)

Communications orales courtes

• Des bactéries induisant la précipitation du carbonate de calcium au service de la consolidation des structures côtières
  Julia Vincent - LIENSs UMR 7266 CNRS, Faculté des Sciences et Techniques, La Rochelle, France
• Les exométabolites de microorganismes photosynthétiques produits par bioconversion du CO₂
  Catherine Dupré - GEPEA UMR 6144 CNRS, Université Nantes, Saint-Nazaire, France

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SP6.2 - Microbiologie environnementale et écologie microbienne

Micro-organismes en interaction avec les plantes

Modérateurs : Stéphane Genin et Eric Oswald

Salle 4 - Niveau S3

• The metabolic cost for virulence in the plant pathogens Xylella fastidiosa and Ralstonia solanacearum
  Stéphane Genin (INRA, Castanet-Tolosan)

Communications orales courtes

• Caractérisation de bactéries isolées de nodules racinaires du trèfle bitumineux Bituminaria bituminosa L.
  Jamal Ibijbijen - Université Moulay Ismail, Département de Biologie, Meknés, Maroc
• Diversité et mobilité des éléments conjugatifs au sein d’une population de Streptomyces issue d’un micro-habitat rhizosphérique
  Caroline Choufa - UMR_A INRA-UL 1128/DynAMic, Université de Lorraine, INRA, Vandoeuvre-lès-Nancy, France
• Deciphering bacterial interactions in forest soil micro-habitats and their impact on tree development
  Milena Gonzalo - UMR 1136 UL-INRA IAM, Université de Lorraine, INRA, Champenoux, France
• La communauté microbienne associée aux graines de pois (Pisum sativum) de différentes origines géographiques
  Valentine Chartrel - GMPA, INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Thiverval Grignon, France

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SP2.4 - Microbiologie des aliments

Bactéries sporulées pathogènes et d’intérêt technologique

Modérateurs : Véronique Broussolle et Christophe Nguyen-Thé

Salle 1 - Niveau S3

• Le groupe Bacillus cereus : du biocontrôle aux agents pathogènes humains
  Christophe Nguyen-Thé (INRA, Avignon)

Communications orales courtes

• Characterization of Bacillus thuringiensis isolates associated to Foodborne Outbreaks in France from 2007 to 2017
  Mathilde Bonis - Unité SBCL, LSAl, ANSES, Maisons-Alfort, France
• Galactosylation of the Secondary Cell Wall Polysaccharide of Bacillus anthracis and Its Contribution to Anthrax Pathogenesis
  Alice Chateau - UMR408 SQPOV, Avignon Université - INRA, Avignon, France
• Dual strategy for mapping the Bacillus cereus thiol proteome
  Fella Hamitouche - UMR408 SQPOV, INRA, Avignon Université, Avignon, France

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SP8 - Histoire et épistémologie

Histoire de la Microbiologie

Modérateurs : Alain Le Coustumier et Jean Freney

Salle 2 - Niveau S3

• Qui a tué Napoléon ? Helicobacter pylori ?
  Christophe Burucoa (CHU, Poitiers)
• Henry Toussaint précurseur de Pasteur dans sa lutte contre la maladie du charbon
  Alain Le Coustumier (CHIC de Bigorre, Tarbes)
• Des premières cultures sur pomme de terre au Maldi-TOF : une histoire du diagnostic bactériologique
  Jean Freney (Lyon)

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SP1.7 - Antimicrobial agents

Modelling clone diffusion and evolution from genomic and epidemiological data

Chairs: Philippe Glaser and François-Xavier Weill

Salle Louis Armand Est - Niveau S3

• When evolutionary theory matters for predictions, and when it doesn’t
  Christophe Fraser (University of Oxford, UK)

Short oral presentations

• In vivo evolutionary trajectory of a carbapenemase producing K. pneumoniae strain in stool, urine, blood and the lung
  Philippe Glaser - Unité EERA, Institut Pasteur, Paris, France
• Quantifying the drivers of antimicrobial resistance in a hospital network
  Julie Teresa Shapiro - CIRI, Inserm, Lyon, France

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SP4.4 - Microbiologie clinique

Approche multiplexe syndromique : quelle intreprétation ?

Modérateurs : Thomas Gueudet et Laurent Andreoletti

Salle Louis Armand Ouest - Niveau S3

• Salmonella, Shigella, entre sous et sur détection
  Sophie Lefèvre (Institut Jacques Monod - CNRS, Paris)
• Méningites et encéphalites virales : nouvelles approches diagnostiques
  Marc Eloit (Institut Pasteur, Paris)

Communications orales courtes

• Évaluation des performances du kit Novodiag Bacterial GE+ dans le diagnostic des infections bactériennes intestinales
  Philippe Lehours - CNR Campylobacters-Hélicobacters, CHU de Bordeaux, Bordeaux, France
• Impact de la PCR Multiplex automatisée gastro-intestinale en pédiatrie
  Jeanne Truong - Microbiologie/Pédiatrie générale, CHU Robert Debré AP-HP, Paris, France